今天呢给大家分享一个软件啊,自己设计的一个软件,是高效率的使用 ncbi blast。 首先呢我们看一下,这是公司测序声控公司呢测序返回来的数据,这个呢一般是点 seq 结尾的序列文件, 那么呢我们就在当前路径呢复制五笔下,然后粘贴到这个 come by excel 里面,我们呢就是要把文件名和序列呢整合到一块,然后呢点击 come by no, 然后生成之后呢直接弹出我们生成的结果, 他呢输出的结果呢是一个 r e s 点 fast a 格式的,我们打开看了一下,他呢就是文件名加上后面的序列,这样呢整合在一块,目的呢就是,嗯进行了 cba 的布拉 那个,后面的还给他射出列出了这个序列的长度。 接下来呢我们就直接跳转到 ncbi 这个吧,粘上,然后选择那个比对核酸呢,我们把刚才合并的文件呢里面的这个序列复制一下, 复制完了之后呢进行 ncba 的批量 blast, 然后我们返回来粘到这个数据框中查看一下,都粘,粘过来之后呢我们然后呢去点击一下 blast, 就直接开始进行比对, 然后进行一个稍微的等待啊,这大概比对的差不多一百多,我可以先暂停一下。 好了,这就是比的结果,我们可以看一下, 嗯,有,他只是列出来一部分啊,列出来一部分,所有比对的结果呢,我们可以选择当当的奥,然后进行选择黑特 table 这个 c s v 格式的,等他下载下来,这就是所有比对到的相似的结果。 然后呢我们是利用这个软件里面的另一个套喷,我们要是肯定要去选择,嗯,这里面选择 top 一,就是选择比对度最高的选择,按照 stop 来排序,那么立马就排出来了, 在我之前分享的视频里面呢,我是使用的一个赛奥,那么操作有点复杂,所以说我现在呢就是直接把这个功能的整合到这里面了, 就按照视频这样选择, 当然我们这可以选择按照 att 来选择, 然后我们看这些结果的列啊,上边是表头,我都已经给大家列出来了,我自己去添加了一些属性,也不是属性,就是做了一些表头的注视, 那么这一列呢,就是 ncba 的这个检索号,也是他的登录号,你呢把它复制出来之后放到一个文本文件里,放到这里之后呢,你另存之后我们要做的事情呢,就是 要批量的去查找一些,查找一下这些到底是为什么,我在这里头班上也做了一个链接跳转,嗯,那么你就可以其他使用,这呢就是查找核酸数据库,选择文件,就是刚才我们存出好的这个文件,然后点点这个搜索, 然后出来这里之后呢,他已经找到一个十七个独立的一个 id, 嗯,删除了一些重复值,那么我们会看到这就是我们比对出来这些里面的信息。 到了这里之后呢,我们要把这些去下载下来,比如说下载他的 cds, 我们可以选择扣定 shus, 然后呢选择 fast a 这个核酸的格式文件打开之后呢, 看一下它里边的就是就是已经爱的一名,开始下面都有他的 cds 区列,接下来就是你就可以去分析下一步如果想要看到他整体就是我们比对到的所有的详细信息呢?你可以再选择这个三兔, 我们看一下啊,这里是比如说他的 id 是干什么的?选择三兔之后呢,你可以选择这个正精油飞车,我们可以选择这个窥特, 这个 come productives, 然后选废了,然后就可以去选择。具体的话你可以去看一下我上一个视频给大家讲解。嗯,那么就到这里了。
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界面出来之后呢,咱们点着这里核光酸比对,这里是蛋白比对,然后这边是核光酸转化为蛋白进行比对,也就是说你输入的是核光酸,他自己转帮你翻一层蛋白,然后进行一个比对,咱们现在是核光酸比对 好了,出来页面咱们从上到下往下看,这是输入序列的一个文本框,咱们把咱们复制的序列粘粘上去 好了,然后滚到下面,这也是啊,比对的是核甘酸,然后这里你可以输入你的物种, 但是咱们选择不输入,比如说你可以选择输入 野猪这个物种, 怎么说呢,如果你这次选择了野猪物种的时候,他就会专门利用野猪这个金主 啊这个文库,然后进行一个啊皮虾,你跑出来皮虾场会进行一个特质的一个啊比对,如果你不选择的话,他会根据 ancba 上啊所有的核酸血液,然后进行一个比对一个变, 然后这时也要选择勾选啊,结果在呈现在新的一个窗口上,然后这里一般是不动他的, 他是高相似性的区别啊,进行一个比对 plus 的时候,经常是要等的 好了,笔袋很快 好了,从上到下,也就是说从这边他的同学性高的会排在最最前面。 那野猪的分离猪 n 一他的 cos 万基因是吧?同源性百分之百,也就是相似性百分之百,也就是证明你跑出来的皮虾产物,它确实是野猪的 cos 万基因。 然后咱们再简介一下这个界面,这里这这些信息比较容易懂,咱们看一下这边你可以,如果你要看到你比对出来同学系高的区别,你直接点击下去, 他就会直接弹出这边的一个窗口,这里是某个基因的一个信息,然后接着咱们进入他的主界面,简直原配。 ok, 这又是回到咱们之前讲过的这个界面,然后如何换了他序列的话也跟上次所说的一样,这直接顶着 fast 的这种格式,然后直接点击 深层,然后直接这边了。好了,这节课就讲到这里,希望大家都会跑出想要的条带坐下。

接下来我们需要验证引物的特异性,我用 n c b i 的 primer blast 网站给大家演示。首先打开 blast 往下翻,找到 primer blast 这个网页可以帮助我们验证引物的特异信。 然后将我们的引物分别粘贴着入 primar parameters 这里的输入框,正向引物输入到第一行, 反向引物输入到第二行。这里的顺序先不要搞错,然后再给这一块选项卡。这里这里的物种请选择我国募集基因的来源物种,这里默认是人。 然后我选的也是人员的白细胞激素二基因,所以不用改,点击 get promise two thousand years late 最好选取的是具有唯一的 p c r 扩增结果的引物队,并且这个 p c r 结果啊是我们的目的基因。 然后可以看到我们选取的这对引物的特异性还是非常不错的,只有一个扩增结果,并且这个扩增结果也确实是我们的目的基因就是人员的白细胞激素二。所以我们就可以将这对引物交给金公司合成。接下来就可以尝试进行 qpcr 实验了。

去年时候给大家录制的一个操作视频,那么在评论区里面呢,看到了有很多的 很多的问题,我们这里有没有什么方法可以把检索到的序列号的来源地也快速批量展示出来呢?然后是博主使用的是什么软件,打开查卖格式的, 那么后面的还有大佬导出的文件只能固定几个列吗?我想把学名加群怎么弄,其实有好多都在问我怎么办,然后呢 然后呢给大家展示展示一下整体的石油 情况,一个是套盆,然后里面呢还有是吹磨案子,这是三个一代测去之后呢可以 根据呢质量测试结果的质量呢进行一个自动的两端的去除,那么这里可以选择。然后这几个功能呢就不给大家介绍了,还有几个几枪功能,我也给他指挥了这些技能呢,这些 这些那个模块呢,大家可能用不到,那么今天呢就是我把之前做的一些工作呢,通过这个软件呢 让他更快的去实现,那么就给大家开始演示一下,首先呢这有批量的局不拉丝,这九条序列,这九条九个物种吧,可以这么认为。 然后在 ncba 上官网上进行粘贴,粘贴完了之后呢点不拉死他,其实这一步呢也可以用程序实现,但是呢 ncbi 上官网呢有一个说明,就是如果一个程序呢在 一天之内呢提交有一百次的话,那么他会把这个 ip 呢给现放到慢的那个资源序列里面弄,所以说我们还是不要还是通过外部网页来进行,这样会 安全一些。等比对出来之后呢,我们选择这个螳螂的哦,选择黑的 table csv, 这个在之前的视频当中呢,也给大家展示过, 从下载时下载完了之后呢,我看啊,我们该用, 嗯,可以打开看一看, 相当于一号,一号的物种呢,他比对到了有九十八十九个,那么这对应他的,这是按照思考的排序,嗯, 然后呢,我们可以去他这是匹配到的他的对应的这个检索号,核酸的检索,我这核酸系列核酸检测号,这是二号物种,以及一共是九个,那么在一千一百六十三个里面去 寻找出来我们那个需要的,我一般都是按照 score 排序, 先不保存,然后好好打开一下,打开之后呢,看一下这个解释一下啊。 top nanabetchantress, 其实,呃, 拿到他对应的解锁号之后呢,我们去获取淘汰他的内容,那么先看一看啊,先把这个先捡走,你可以在这个工作目中进行操作,嫌他乱,所以说放到临时文件里,这有一个线索哎, 他可以把他直接拖进来,然后呢一个白色扣一个白按得体,这可以选这个呢,我是勾选的欧内这个核酸裤啊,这个根据登录后面直直接检索这个物种的信息, 他也可以用蛋白裤,还有很多,我这里呢参数呢,我就是设定的是核酸裤,我限制死了,因为 啊不想增加那么多工作量啊,其实就改个参数就行了,如果大家有需要的话,我可以把这个功能这块给大家放开,然后呢套喷一望着你,我们来做几次,我想要套喷一点开始,那么他就会 进行一次通过网络上的传输,我们来看一下,哎,已经拿到了,首先呢他会自动下载一个,呃,这是 top 一里边的这五种信息,这样是 这个插麦耳文件,所以说有的同学呢就是问我这个插麦耳的文件怎么打开,所以说我就在这里的软件呢,是自动给生成了一个呃,一一对应好的最终结果啊。电视看,这是 一号,他对应的嗯,登录号,然后这个登录号,这是最开始的 csv 那个,我们那个布拉斯出来这些 是告知了,然后有多少 gap, 是从从多少到多少匹配多少,这个是那个五种的 top c id, 那么我们看一下他是什么,他是小麦,这是小麦,然后包括呃下面的对应的每个都是什么,以及他的描述,他的定义, 然后他后面的是跟着就是比对好的这个序列,这是这个来自于这个物种的硬气。边上公布的这些序列已经就放到这里了, 这是套个一,然后我们看一下,嗯,当然了你也可以看一下,套个二,然后点,同样套个三,再点,然后套 四,接着点啊,这是走了一个多县城啊。然后就是,嗯,如果这个完成的话,他这个 显示状态显示为四个 c 的,四个 c 的,然后或者是如果有一个文件下载,如果特别大的话,比如说你按照九个按照速高之,然后点开始的话,他会特别慢,而且下载这个也出不来,之后这个出来里面的序列特别长,而导致这个 程序这块的阻塞,所以说你可以点看守,我就不要走这块了。这个是仅仅做了一些简单的一个测试啊, 我们去看一下,按照这个排序查看,按照详细列表,按照日期,日期道序,这个是出来的,我们看 每个文件都都用在对应的他的拆卖文件,可以大家去做个脚印,这是四个,看到没,这 top 四, top 四是对应的是这几个,那么后面的信息 这是一个,呃,这个软件里面呢,还有我开发这个小工具里面还有一个盖子赛克白 id, 这个呢,这个用法呢,大家可以去看以前的视频,我也做了说明,然后 combas 有个范儿,这个是测序文件的,批量的, 批量的组合起来,然后方便使用。在这里 ncba 上呢,也就说这个格式整理,我在这里用了他 combasecophoney, 用他来做了一个整理,可以拼起来这么多不同格式的文件放到这里,然后进行 ncba 的批量,不拉丝的。 然后再讲一下这个吹木案子,这个测序在测序里面呢,我有收到这些测序文件呢。啊,吹木案子,他的 ab 一格是文件, ab 一格是, 嗯,就是他的测序风图,这里呢就是我设计的几个值,那么十呢?如果选择十的话呢,这个概率呢?有百分之九十的可能性是测序的准确度,那么三十以上就百分之九十九点九九九,后面四个九,那么 这也是我查一些资料知道的,那么五盒把我自己设定的,嗯,所以说在这里的话,就是目前是设计的,是大家去点选,嗯,本来想做成输入数字的话,那么我正好前面的有这个模板,我就直接套 好用了。所以说五和八,比如说我们选择一个五,然后希莱克特选择地盘 tamp 测序,就这个文件夹里面,我要把批量的 ab 这个三格测取的文件呢,全部给他自动来切除的话,那么我们会质量高一点的。如果都大于,这是大于等于三十用,如果大于等于五的话,点凹凸,然后已经结束了。点确定 啊,软件还设置自动跳转啊。这个是为了方便大家去检索一下,他就是生成的文件是在当前的目录下 啊,这是生成完的,我们按照名称排下去,就是一一对应。好的,嗯,我处理好的,把这些中括号什么都处理的是方便。 嗯,一会给大家再展示一下啊。展示一下,这是测序文件,我们测序拿到这个之后呢,我先比对一下, 嗯,就这样,刚才我做过测试看一下,那么去除了前面的有十一个, 那后面呢,会去说多一些,呃,九百一以后,这是这个值大于五的,那么大于二十的话呢,当然去说会更多。 然后这里的话再给你展示一下 combaocombaoxicophil, 比如说我已经吹木案子了,吹木之后呢,我可以再选择这边地盘 tempu 测去,就这个文件夹里面没选。这是赛克,这是公司返回来之后,他自己有一个 c 款式,他从 其实就从 ab 的转直接提出来序列文件,那么这里呢,我用 txt, 就是我刚才自己去去母完了之后呢这个,然后我啃白闹,然后他最后会合成到一个法塞格式文件,这也做了一个弹窗, 这个发 c 大家看出来没,这是他的名字,然后后面对应的他的序列,这样的话,你可以拿着这个 ctrla 复制完了之后呢,在这里再粘贴,这里就直接装不拉丝就完事了 啊,整个整个这个软件呢?这样操作下来是非常快的,如果大家还是有什么不懂的话,可以在评论区里面问我吧!

前面的课程中我们详细介绍了 plus 工具的使用,今天我们来介绍一下 plus 加工具。从命名中我们其实就可以看出来, plus 的加是 plus 的高级版本。 从 plus 软件出现至今,已经经历了多次的升级,功能性能逐步提高,但是同时也使他的原代码被修改了,凌乱不堪,难于维护,这样就极大了限制了对 plus 的进一步的升级。 普拉斯的维护者们决定重新开始重新编写代码。二零零九年七月, ncbi 发布了 blus 的升级版 blus 的家。 blus 的家使用了 blus 的核心算法,延续了 plus 优势,功能发展并增强了 plus 的功能,新增加了哈佛队的 plus, dp 等程序。 plus 家是一个全新设计的程序,在性能以及应用性上均有了很大的提高,清晰的模块化将极大的提高维护者的效率。 ncbi 官方网站也强烈推荐用户放弃 plus 的使用 plus 加工具。 下面我们来介绍一下 blus 的家相对于原有 blus 的一些特性。 首先,高度模块化是本次修改的主要目标,不仅从理论上,更是从代码上明确 blus 的三个过程, blus 加选择的 isoc 九十九标准使得原代码可以同时被 c 以及 c 加加使用,不需要做任何修改,不让施加。增加了对的被子骂十个。 之前的版本需要使用第三方软件,如雷劈的马斯克来马斯特的数据库,现在内置了 window 至马斯克和大舍来进行重复序列的过滤,非常的方便。 新软件使用了匡威、史布利特、二维头、萨布寨和塞库人瑞翠偶以及多种策略来提高长序列的比对效率,有效的降低了 cbo 的时间,充分利用了一二级缓存。 普拉斯加将原来的长参数变成了短差数,添加了长字符串作为参数的支持,如输出选项现在为刚奥特而不是以 前的杠欧。添加了马斯克 plus db plus db、 俄莱斯 tus plus bc、 布拉斯 bcmd 三个数据库有关的程序,增强了数据库方面的处理。添加了掰丝黑的算法,只输出最优的黑头。这个其实是学习了最新版的发丝 a 比对软件 还有很多更好的改进项,大家可以通过查看 acbi plus 加 renice note 来查看。 我们可以从 ncba 官方网站下载 plus 加工具,最新的版本为二点三零,里面有多种版本可供选择,这里面我们选择编译好的 ex 六十四位版本,下载之后上传软件至 ex 的服务器, 我们使用 t 二杠 gx v f 面进行解压说, 解压说之后记录软件安装目录,然后再进入闭眼目录下,里面包含了很多可执行的程序, 每个程序直接敲命令之后接刚刚哈尔滨选项就会输出帮助信息。具体每个应用的作用,大家可以访问 ncbi plus 加的在线手册进行查看。 下面我们来介绍一下 blus 加软件的使用。 blus 加与 blus 的在原理上其实是非常相似的, 那么也是需要先对目标序列建立所引,然后再进行比对。 使用麦克布拉斯的 db 命令来对目标序列建立锁引,这个过程类似于布拉斯的工具当中的方迈的 db 过程 叫麦克 plus tb 钢印接带格式化的系列文件 杠号的为输出数据库名杠 db 太版为数据库的类型核酸或者是蛋白质,核酸为 nucl, 蛋白质为 prot, 所以你建立完成之后就可以直接进行比对了。 plus 加相对于 plus 工具,将各个比对模块单独列出来,例如如果是和穿与和穿比对,就直接选择 plus n 工具,氨基酸直接选用 plus p 工具。核酸比对蛋白质则选择 plusx 依次类推,而不再通过放屁选项来单独指定。 我们首先来进行一下核算与核算的比对,将 blus n 命令后面接杠杠汉堡就会弹出很多选项, 这些参数绝大部分与 blus 的工具非常类似,只不过换成了长选项。杠框位为输入文件杠奥的为输出文件杠。 db 为目标序列建立好的锁引 刚好的 mft 回指定输出文件格式总共有十二种, 这里面第六种对应了 plus 当中的 m 八格式。杠一歪六 为输出结果的一值,杠南博迪斯科瑞克森为输出格式结果的条数杠南博十二的为现成数。 这里面我们来具体演示一下。 回车之后比对就开始了, 我们看到最终输出的结果与 plusm 八格式是一致的, 下面我们看一下蛋白质系列比对蛋白质数据库我们选用 plus p 与合算类似选项也差不多,下面我们来具体演示一下。 普拉斯加工具,相对于普拉斯改进两个地方还是非常多的,而且二者在运行方式上也完全不同。 我们在服务器中准备了 plus 加软件的使用脚本和设置数据,希望大家能够多多练习。

真菌的分子生物学鉴定,那么真菌一般情况下我们有两种分子生物学鉴定的方法,一个是做十六十八 s rda 的测序,一个是做 its 测序,那么两种方法跟细菌的呃那个分子生物区鉴定的方法一样的,那么十八 s 的话有很多影物一般用 nsens 八,那么 its 一般用 its 一和 its 二 引路来进行劈叉,劈叉结果有长有短,一般情况下是三百 bp 到一千多 bp 之间不等,那么呃劈叉的结果我们进行测序,测序之后进行 ncbr 上进行 plus 的, plus 的结果有的时候会不一定会到达这个种或者是呃亚种,那么一般情况下都能够达到这个属。最终我们还是要结合呃真菌的,比方说霉菌的这种菌多的形态来进行呃进行辨别。

在我们获得基因的序列后,接下来就需要用到影物设计软件,这里我们介绍 primer。 打开 primer five 软件,选择 file new dna sequence, 弹出基因 tank, 然后我们把之前找到的 smack five cds 区 剪辑序列, ctrl v 粘贴,这时弹出一个框,选择 as is, 注意文名。一般输入的序列长度控制在一千以内, 如果大于一千 b p, 那么我们需要随机截取小于一千 b p 的片段,进行多次筛选设计。 然后点击 primer, 在新的弹出窗口选择 search p c r 产物的长度通常为八十到二百 b p, 我们设置好,如果是 circ r n a, 那么这个产物长度设置我们一般不超过一百 b p。 在影屋设计原则 则中有一条就是引雾长度一般在十五到三十 bp, 我通常设置十八到二十五 bp, 我这里设置为二十五,加减三 bp。 然后点击 ok 按钮弹出的新窗口 search results, 按引物的评分进行了优先度评分,点击每个结果,可以在 primer 窗口看到具体细节。 这时候我们需要看 t m 值,一般是五十到八十度之间,我一般会将 t m 控制在六十度左右, 然后 gc 的含量需要在百分之四十到六十之间,库增产物在八十到两百 bp 之间,最好是没有发卡。二具体等这些情况,然后在这个基础上评分越高越好。我们发现这些结果都不太好,我更换后面一段序列重新进 进行分析。我们找到一个各方面条件都不错,但是正义恋和反义恋,我们建议 t m 的温度不要超过一度,保持在六十度左右, 这时我们点击 s, 然后 add primers 对正义链进行调整,在五撇端或三撇端删去剪辑,这样就会降低 t m 温度。 点击 analyse 看一下 t m 值,然后点击 ok, 接着选择 a, 点击 added primers 对反异链进行调整。 想要升高温度可以在两侧添加剪辑,但是注意一个引物的两个原则,引物三撇端避开密码子的第三位引物三撇端不能选择 a, 且三撇端最后五个剪辑内不能有多于两个的 g 或 c。 我们尽量避免选择的引物。还有这些情况,但实在没有的话 也没有关系,可以先 copy 下来试一下。点击 add it copy sense primer 或 anti sense primer, 复制设计好的上游或下游引物序列。接着进行初步的比对。打开 ncbi 的 primer blast 数据库,在 primer parameters 窗口中输入刚复制的引物, 在 database 中选择 raptic mrna, 如果是 link rna, 则选择 raptic rna。 在 original 中填上种数,然后点击 get primers。 最后我们在结果中会发现比对后出现的基因都是 smack five, 所以这个引物基本上是合格的。至于最后到底可不可以,我们还是需要通过电用确定其条带大小或者 q p c r 进行验证,看其溶解曲线是否为单一风。 最后我们来说一下 microina 的影物设计。 microina 的影物基本上是固定的,我们以 hsa, microina, nineteen three p 为例,在 microina base 获得 microina 的成熟序列。 针对 microina 的引物,我们需要设计一个金环逆转路引物,它是由五撇端进环序列加 microina 序列的三撇端六到八个剪辑的反向互补序列组成, 而 q p c r 引物,正向引物就是 micro ona 的无撇端。选择十三到十六个特异序列就可以了,不包含逆转路引物中包含的最后几个剪辑反向引物就是景环部分,去任意片段,保证上下有引物的 t m 值差不多就可以了。必要时候 我们也可以在正向影物添加 g c 以提高 t m 值,使得上下游影物 t m 匹配。所以相对于 m r 内 link r 内、 circ r 内的影物设计, micro r 内更简单固定,你学会了吗?

啊,大家好,欢迎来到维赞学堂啊,非常荣幸呢可以同大家分享 q p 三影物设计的相关内容。 今天呢,我们主要围绕四个主题进行展开,首先第一个呢是 q b 三影物设计的相关原则,第二呢是把基因序列的检索,第三呢是常见影物设计软件的使用,第四呢是 q b 三影物实验的一个验证 啊。首先呢,我们来了解一下 q p 三引雾设计原则啊,这些呢是 q p 三引雾设计的一些原则,大家可以跟着我一起过一下这些原则。 首先呢,这个 q b 三的这个产物长度呢,要在八十到两百 b p 最好是在八十到一百五十 b p 这样的一个范围之内啊, 引物的长度呢是十八到二十五个 nt 上下游引物差别尽量不要大于三个剪辑三撇端尽量避免高 gc 或者是高 at 含量的这个区域。 三撇端呢,最后一个简记最好为 g 或者是 c, 但是尽量避免连续出现两个 g c 这样的一个结构 啊。正反向引物的 tm 值最好相差不要超过一度,引物 tm 值呢,调整要接近于六十度啊,这个 tm 值最好是使用引物设计软件来进行计算啊, gc 含量在百分之四十到六十四种剪辑在引物中均匀分配, 尽量避免 g 或者是 c 或者是 a t 的这种连续的结构啊,尽量避免有大于三个简计的 反复重复序列,或者说是自身互补的序列存在啊。看完这些原则呢,有些老师可能内心慌掉了啊,这么多的条件,影屋设计真的是好难呀。那其实对于 qp 三影屋设计来说呢,他只要把握好第一条, 也就是说我们要控制产物长度在两百 bp 之内,我们这个 q p 三就基本成功了一多半了, 因为 q p 三主要功能呢,它是用来进行基因表达量或者说是拷贝数计算的 啊,扩增效率呢是非常非常重要的,那片段越短呢的这个扩增效率就越高,而市面上我们常用的这些 q p 三世纪呢,在扩增产物超出两百 b p 之后,扩增效率呢就可能 会发生一个下降,所以我们的这个 qp 三产物长度最好是控制在两百 bp 之内啊,所有的原则都遵循的情况下,设计的这个影物呢,质量肯定是不用说的了, 但是反过来说呢,并不是说除了第一条原则,其他几条没有完全遵循,但是偏差又不是很大的情况下领悟就一定不好用 啊。影物设计完了以后呢,还有一个非常重要的一个步骤,那就是需要在 n c b i blast 检索一下我们这个影物的特异性,看一下这个影物会不会结合在其他的序列上。 那了解了影屋设计的这个原则以后呢,接下来我们再来看一下如何查找靶经序列啊。首先呢,我们要打开这个 nc bi, 在检索框中呢,我们选择金,然后再填入把金的这个名称啊,比如我们这边填入的是常见的内参金 gap dh 啊,填好以后呢,我们再选择 search 啊,可以看到他一共检索出来了一千七百八十三条结果啊,为什么会出现这么多的内容呢啊,因为我们输入的这个 gap d h 呢,它是一个关键词啊,所以呢会出现 gap d h, 它本身以及相关的其他经 啊,但是我们所要寻找的这个 gap d h 金序列呢,它是排在前面的啊,我们来看一下这个页面上的信息啊。首先这个是 gap d h 啊,它的一个描述啊,它这个位于染色体的位置,以及它的一个金号啊,它的一个别 称啊,这里需要跟大家强调的一点,这一块后面呢,就是描述的后面呢,它是有一个相关的物种信息的啊,比如说第一个 w h, 它是来源于人的,第二个呢,它是来源于斑马鱼的, 选择我们目标物种的 gap dh 呢,点击进入,比如我这边选择的是人员的 gap dh 啊,页面跳转以后呢,我们找到这个 mra 和 protein 这个栏目以后呢,可以看到他这边有很多的这个 nm 号 啊,这个 n m 呢,代表的就是 m r a 序列,也就是说这个基因呢,它会有很多个雅型,我们需要确定目标这个把基因,它到底是哪一个雅型,对应哪一个 n m 基因号 啊?每一个 gabdage 的雅型,它的一个突变点,或者说是它这个功能跟变更的这些地方呢啊,这边都有一个非常详细的一个阐述 啊,点击把基因,比如说我们点击的是第一个啊,这个 nm 基因号以后呢,他页面会跳转为下面这个图片啊,我们同样拖动鼠标往下啊,拉动,可以找到这个 features 这个界面啊,这个呢, 选择这个金金啊,就可以找到把金的这个 mr 序列信息了,也就是我们右边这张图上所有的这个剪辑序列啊,就是这个金的一个序列, 就是我们这个 w h m r a 的一个序列信息啊,然后呢我们再点击 c d s 序列啊,右边这个标黄的这个区呢啊, 显示的就是我们这个 gam dh 的一个 c d s 区了,然后呢我们就可以根据自己的需求来进行设计 q p c r 引雾了 啊,那接下来呢,我们就来了解一下啊,常见的这个影物设计软件,以及他们的一个操作使用流程啊,常见的影物设计软件呢啊,我这边啊罗列了有两种,一个是 a little seven, 一个是 primer five 啊,我们来介绍一下这两款软件的一个使用啊。首先来看一下这个 only go seven, 欧力够 seven 呢,这款软件的功能是非常强大的,嗯,尤其是他对这个引物质量评估这块呢具有非常强大的一个功能,我们一起来了解一下如何使用欧力够 seven。 首先我们打开这个 only go seven 呢,它左上角有一个 file 啊,点击它会有一个下拉框,我们进行一个序列的一个新建啊,点击这个 new sequence 呢,会弹出这样的一个界面啊,我们把我们的靶经序列输入到这个框里面, 选择对勾,然后呢这一块呢就可以完成了我们这个序列的一个新建啊, 点击这个对勾以后呢,他会弹出来这样的一个界面,这个界面呢他有呃,主要就有三大块信息, 左边这个信息呢是描述了我们选入的选中的这个靶经序列呢,他的一些啊,比如说长度信息啊,他这块是一千三百二十九个剪辑啊,然后就是目前选中的这个区域呢,他是有二十一个 nt, 然后他的 t m 值等等这些信息啊。右边这个框里面呢,主要是描述的是我们这个影物的一些信息,但是我们这边还没有开始进行影物的设设计,所以说呢,这边信息是空着的 啊。下面这个框里面呢,描述的是我们这个把金序列的一个整体的信息情况啊,这个黄色的区域呢,代表的是选中的这一段区域呢,他这个剪辑呢,他会在下面这几个框里面有一个放大,我们就可以具体的看一下他这些信息了 啊,我们分别来了解一下啊。首先对这个整个序列的清晰,我们来看一下啊,这个高高低低的这种蓝紫色的这个风图呢,他是指的是 tm 曲线图啊,也就说这个风值越高,说明他的这 个啊模板这一块区域的它的 g c 含量是越高的啊。下面这种不同颜色的线段呢,它又代表什么含义呢?比如说这个深红色的这个线段呢,代表的时候我们这个模板区域可能会出现 比较强的这种发卡结构的这个区啊,这是可能会形成强发卡结构的区啊。这个红色的这个区呢,代表的是我们这个模板可能会形成比较弱的这种发卡结构的区啊。这个绿色的呢,代表的是一些回纹序列 这个黄色的区域,刚才我们有提到过,就是选中的这个区域呢,他会对这个区域有一个单独的分析啊,那就是下面这个框里面所显示的信息啊,这个竖线呢,代表的是我当时这个鼠标的这个位置啊, 这个鼠标所指的这个剪辑,它在整个模板上的一个呃位置以及它的 t m 值呢,在右上角这个框里面是有显示的 啊,这个灰色的区呢,代表是目前我们选中的一个二十一个剪辑啊,然后下面这个栏目里面的信息呢,代表的是我们这个呃剪辑序列翻译出来的这个蛋白序列, 这个红色啊,绿色这些线段信息呢,和我们上面这个图里面的是啊,描述是一致的。 那我们说新建好序列以后呢啊,后面呢就要对引物进行一个查找了,如何来查找呢?同样是恢复到这个奥利勾七呃 seven 的这个原始界面,然后点击色尺会弹出一个下拉框啊,同样选择第一 第一个选项 for primers and proves 啊,点击这个以后呢会弹出啊,我们右边的这个界面,我们主要关注的是这两个部分,一个是 parameters, 一个是 ranges, 我们一一的来看一下,首先点击 pro 呃 parameters 啊, 我们主要关注的是中间的这个 constraints 下面的这个 primerland, 也就是说我们主要关注的是这个引物长度的一个设定,我们可以根据他后面的一个加减 一个数啊,就是代表的是他这个影屋的一个范围啊,一个设定的一个情况。而其他的这些参数呢啊,不建议您去随便的去改动,就按照这个软件默认的这个参数来进行设置就好了啊,这个选定好以后呢,我们点击 ok, 然后接着我们再设置 ranges 这个参数啊,点击以后呢,它。

今天呢给大家演示一下本地 plus 的功能,该界面呢包括序列的输入,还有结果展示,以及下面的这个 plus 的 tips 就是它的操作步骤,那么按照这序列的输入, 然后呢选择你需要比对的程序和数据库,然后就是结果的展示在参数里边,这包括 blas n, blasp 以及数据库的选择,比对的预值设置,以及输入的格式。输出的格式没有数据库呢,这里呢我们要 new 一个 database, 那么这里面呢要输入的是 你选择 fasa 格式的这个文件,那么因为我这个屏幕啊是两个屏幕,所以说你点去 open, 然后呢去找一下,然后呢要选择这个数据库的类型,一个是核酸还是蛋白,然后呢输入你的 代特贝斯就是数据库的名字,这是你自己起的名字,我们来演示一下,那么找到自己的库,我呢就是,呃,这里的库呢,也就是我们下载好的,或者是呢公司给你的这个 fasa 格式的文件,那么里面就是有, 嗯,这个是核苷酸的啊,核酸的这个库,嗯,这些序列呢发四 a 格式呢,我们来看一下有多少个这个 cds 或者基因呗,大概你看这是有,嗯,差不多有一万六, 一万六千多啊,这样子的话,我们就是直接把这个文件呢直接拖在这里看啊啊,这是拖拽,也可以支持 open 点选择。选择好之后呢,把这个库直接拖进来,拖进来之后呢,当然我们这是要选核酸的库, 然后起个名字在这里呢我起一个 test 就做一个 test 酷就行了。设置好之后呢,然后我们就点击 new d b 扭一个 database, 然后就等待它的创建, 创建做了一个模太框的弹弹窗提示啊,这个已经剪好了,然后这里呢我会发现下拉数据库的这个地方呢,有出现我们的这个库,嗯,接下来我们就开始要进行 blast, 这就是 blast n, 打开这个文件就原始的库里面,我们去找找一点序列,随便挑一个吧,挑一个就是拿这个,那么当然呢是,呃,在这个展示的时候,嗯,我们呢要是以 fast a 格式所谓它这就是一个大于号开始, 是吧,然后上面就是你的基因名字,那么这里也就说个太死一,把这个这段序列粘上来,然后选上酷,嗯,因为这个比对呢是普拉斯恩 选择预支然后输出的话,我们是表格形式输出,或者呢是你看这里面有好多,是吧?先点开始,之后呢他就运行等待一会 比特出结果,之后呢它会一个弹窗提示,然后呢结果呢就直接就是输出到这里可以选择导出到一个 txt 文本里面,在输出格式的时候可以选择这个比对模式,就是它会输出一些那些比对线, 嗯,那么我们看一下,这就是下面是比对好的,这里呢你需要,嗯全选复制或者导出 出到 t x t 我这里呢就直接复制一下粘到记事本上,那么大家会看见这样呢,一一对应的,嗯,这些比对模式都应出来了, 当然这是单个序列的比对,我们也支持呢这个多序列比对。其实呢这个软件呢就是这个模块啊,这个功能的就是, 嗯,把那个 ncbi 自带的那个命令行的那个比对呢,我已经被封装起来了,然后做了一个界面,是吧?可视化操作, 然后呢我们看一下多序列比对,那就是刚才我们粘完之后呢,做一个台词二是吧粘到这里,然后还是选预值,然后这输出的这个 格式,然后开始比对之后结果就出来了啊,然后就比对到这个 test 一呢就是 test 二,它都对应对应到我们这个库里面是谁,然后从哪是开始是吧?相似度数覆盖多少,这个都会,就是正常的输出格式。 回民领航的同学呢,也很清楚这种输出的格式是什么样子的。数据库展示主要是根据你前面这个 program 的选择,呃,选择这个 blas n 的时候会出现这个核酸的水库,那 blas p 则没有。 然后呢就是同样一个库啊,我们可以创建多个,比如说再来一次啊,这个呢,然后还是选刚才的文件呢?接下来呢就是选择核酸数据库,给这个库呢,再起个名字,跟之前呢要有别的一样有特色。 db 二,然后点一下 d b, 这样就会创建创建一个新的库,新的库呢,这样子的话会发现在下面呢会有两个,对吧? 下面呢给大家来就是找一下这个库到底创建在哪里,那么正好呢是安装软件安装的位置呢?这个 v kiss 下面有个 n c b i n c b a 里边会出现这不两个库,第一个就是咱们创建的这个 test 库,另外一个是刚才咱们创建这个 test d b 二这个库, 嗯,这个库就是正好 n c b a, 你用的命令行之后,它也会创建这些文件。 接下来呢就看一下这个删除啊,删除库是怎么做的?这里呢?我没有做二次确认啊,就是点删他就删了。嗯,我展示一下,我选个地面点个 delete, delete deb 是吧?然后这 这个库呢,直接从你的磁板上删了,所以说要慎用,不要瞎点。然后呢这里呢有台词库呢,我们下拉选中,然后再填 delete, 是吧?就结束了就没了。 嗯,行,到这里呢已经把整个这个数据库的呢,增山还有查。嗯,给大家做了一个一个简单的一个介绍视频介绍,那么欢迎大家呢,来关注我更多的教程。


大家好,我是小明,今天来录制一期视频,介绍一个生物新学入门常用的一个内容,就是如何在 ncbi 这个数据库里面查找自己目标物种的原始测序数据。 好了,下面就开始实际操作。呃,下载原始测序数据的话,就是查找原始测序数据,我们大约分成两种情况,第一种情况就是我们已经有自己的目标物种了,但是 并不太清楚想要下载具体哪种实验的数据,我们只是想大概的看一下这个物种都做了哪些关于测序方面的实验 啊。如果是这种情况的话,我们就直接在 ncbi 里面搜这个物种的拉丁名,然后找到他那个原始测去数据存储的那个数据库,然后我们来可以一个一个的来浏览啊。如果是这种情况,我们就直接在这个 bing 搜作引擎里面搜 这个 ncbi, 然后他第一个跳出来的就是他的官方链接,官方链接点进去以后他就是这个界面,然后我们就直接在这个搜索框里面搜目标物种的拉丁名就可以了。比如这个地方我用苹果来做演示,苹果就是马路 marus, 然后直接点这个搜索, 他跳转的界面就是这个样子。然后如果是原始测序数据的话,我们主要就是关注的这个 sra 这个数据库, 这个他列出来这个出库里面存储的一个数量,我们可以看到这个苹果的存储的原始测试数据相对还挺多的,毕竟苹果是一个相对就是研究比较多的一个水果。点进去, 然后点进去以后,这个就是他所有原始测序数据的一些内容啊,他这个 面是显示二十个,二十个条目,我们可以如果是内容比较多的话,我们就把这个改一下,比如可以选择两百, 选择两百,这样的话看起来就不用一直翻页。下面就是他的内容啊,他这个数据包括基本上所有的原始数据,他都是存储到这个数据构造。比如这个他是红军组测序的,然后 啊全金组测序的数据,然后转路组测序的数据全都在这个 s r a 数据库里面,然后他左侧这边有一些大的分类,比如如果你只关注金组测序的数据的话,就关注这个 dna 就行了,或者你关注转路组的啊,通常就看这个二人 a 就行了。 然后他这个还有什么稳酷的类型,就是双端还有单端测序,然后就是测序的平台这块有这么多,然后测序的策略这块,然后还有文件的类型等等,他就会在这个地方列出来啊, 然后我们就一个一个的来浏览就行了。他说前面他是一些红金组测序的内容,然后这些全都可以点进去看,但是这个列的都是样本的名字,有的通过样本名看不出来他具体的内容的话,我们就点进去, 然后他就会跳出来这个界面,跳出这个界面他就会对这个测序数据来这个测序数据的来源做一个详细的介绍。他这个比如就是基本的实验设计,然后他这个就是研究的内容啊,然后他这个会有一个摘要,就是借题介绍一下他这个测序数据大体做的是什么内容, 然后这块就包括这个文库啊,然后测序平台啊,然后测序策略,然后来源,然后就是下面一些方式啊,这这个就是单端双端啊。然后这个地方最重要的就是这个 sr 这个号码,如有了这个号码以后,我们就可以直接下载他这个测讯数据。然后还有一个就是还有想看 其他内容的话,我们可以点这个不要申剖, 然后点这个白色墨里面,他这个这块里面就还有一些额外的信息。比如我如果说是做果树的话,就会很关注这个 数据是来自于什么品种啊?或者是来自于什么组织类型,比如是来自叶片啊,或者果皮啊、果肉之类的这些内容在这个地方通常都可以查看到。然后还有这个比如这个数据你是感兴趣的,还然后接下来就可以点这个 bell pruperz plug 的这个里面,它有 就可以找到他这个整个项目下面所有的测序内容。说点这个柏尔森木里面就是一百六十四个内容,我们点进去, 然后这个这次他列出来的就是全是关于他这个同一个研究内容里面的所有数据,这个我们就可以一个一个的来看就行了 啊,就是现在目标物种确定,如果就是想大概看一下这个数据有多少的话,我们就用这种方式。还有一种方式就是我们看到了一个论文,然后我们想把它这个论文里面的数据下来下来的。 这种的情况啊,也是差不多的。比如我就以这篇论文来为举例的话,他这个如果是涉及到测距数据的论文,他通常会在文章的结尾就是告诉你这个数据是 存储在哪,以及他这个存储的那个相关信息,他通常都会有这个内容,比如他这个就是我们需要找到的内容,就是对应的有一个这个号码,就是 p r 接 an 开头的这个号码,然后找到这个号码以后,我们同样的是打开 ncbi, 然后就是 直接搜索他这个号码,找到的就是同样的内容,就是 b 二接 n, a 五九幺六二三, 在这个里面 p 二接 n, a 五九幺六二三,然后我们直接点这个 s, 他跳出来的界面和我们所有拉丁名是一样的,但是他这个就会把范围局限的很小,就是只有他跟这个号码一样的话,就是这个,同样的是 sra 这个,但是他这个里面就是一百二十七,就是全是和这篇文章的策略数据有关的那些内容, 你看到同样的就制这么多了,然后他这个默认的是还是二十,我把这个二十改成两百, 然后他就会把所有的内容全都显示出来,然后就根据他这个题目就大体看出来这个数据是关于什么的内容,如果实在看不出来,就点进去一个一个看就可以了。好了,今天的视频内容就介绍这么多,然后 大家如果觉得视频内容还有帮助的话,可以点赞关注,投币转发进行支持。也欢迎大家关注我的公众号,小明的数据分析笔记本,留言讨论本期视频相关内容。然后我的公众号主要是分享的内容就是二元和拍子做数据分析和数据和说话的简单小例子,然后还有一些生物学、医学入门的相关内容, 大家感兴趣的话可以关注一下啊。下期视频会跟大家介绍一下如何就是找到了这个测试数据的编号,我们如何来下载他原始的测试数据?好,谢谢大家的收看。

今天我们来看一下如何使用 gu twor 这个在线分析工具进行简单的差异分析。首先我们点开这个网址,打开他的主页, 呃,因为今天网比较慢,所以我就提前打开了要看到的几个网页页面, 这里呢我们输入我们要进行分析的数据一和这个 gse 一二四九三七, 点击搜索就会来到这个界面 啊,这里一定要选择 和地理数据级,地理区域数据级,不然的话他出来的结果就包含很多类,很多类相,不太方便我们去查找。 搜索之后呢,打开的是这个,然后我们这里选择第一个来自然肺癌细胞系 ncah 二九二的表达数据。点进去以后呢,我们会看到这个界面, 这里我们看到可以看到几个信息,第一是他的这个软件平台, 呃,不能叫软件平台,就是他是芯片机遇的那个平台, gpl 五七零,这个是一个很常见的呃人 人的探针所给予的一个平台,然后这些是他这个数据及包括的一些数据样本。然后我们就点击这里的 anasvid gl twor 进行展现的差异分析。 首先在这里我们要选择他的定义组,这是我之前选择好的 test 和 contrast, 分别是测试组和反差组,相当于一个是实验组,一个是对的对照组。 选择的话我们就是按住 shift 选择你想要让我选择的这个, 呃,要分类,要进行分类的这个,这个 step 这个数据集,然后输入名字就可以获得这样这么一个分组。 我这里呢就不重新分了,因为是已经分好的。注意这里一定要分成两个组,至少两个组,定一组和实验组,这样的话才方便我们之后的结果。 然后点击这里的分析, 可能中间使用这个分析的过程使用的时间可能会比较长, 需要多等待一下。 嗯,这个是一个没有办法的事情,因为在线工具吗?并且他是免费的,他的这个速度不一定能够 他满足大家的个性化需求, 你重新点一下, 看好左后点击分析。 今天这个不知道怎么样了,非常的慢, 但是过程的话就是这样子,之后我们后续会补排一下如何对他的数据进行处理。哦,好了,在他进行了差异分析的后的这个数 得出来的这个数据页面里呢,我们可以看到这个探针的 id 第一列它的矫正过的厚的 py 六值,这个一般是以零点零五为准,代表他的这个偏差值非常的小, 还有他的 p 八六,这是矫正后, 然后大家 t 知道给 fc 基因 simple, 这个基因 simple 呢,我们之后还会用到,我们需要把它转成 interestid, 然后再进行后续的负极分析。 然后这里呢,我们就可以点击这个刀楼的 fogtape 进行下载,这些是他在分享 过程中或产生的火山图,三点图,一些相关的数据,还有这框线相线图什么的,大家可以根据自己的需要进行一个下载, 图像零存位即可保存。呃,这里有一个 ice cream, 呃,因为本质上呢,这些这些图都是用二语言这个统计软件做出来的, 所以说这些代码如果我们把它用到这个二元的, 用在二语言上进行运行,是可以达到和这个达到 这些尘土的,但是这样的,但是使用这个代码呢?是需要一定的这个基础的,如果没有这个基础的话,就可能会出现各种各样的问题, 所以如果大家想要在这个差异分析生性商进阶的话,还是有必要去学一下二医院的基础的。好的,今天就到这里。

输入需要查阅的目的基因,点击回车,右侧显示的是部分功能区,中间为该基因的简单信息,点击后右侧列出整个网页的目录, 右侧为该基因详细信息、位置、图谱表达量、相关研究文献、功能注视等。嘎嘎好用。


大家好,我是邱老师,今天我们来学习第六章趴麦的解锁,那么首先呢,我们先来了解一下趴麦的, 他们呢,是我们这个生物医学领域里面最广泛,也是应用的最重要的一个数据库,那么它是由这个美国国力卫生院啊,叫 nah 下属的美国国力学图书馆内心哦, library of medicine, 那么他下面有个机构啊,叫做 ncbi 国家生物协信誉中心,那么他开发和维护的,那么他是呢向全世界免费开放,那么他的这个平平台呢,就是整个就整合在这个 ncbi 这个平台上啊,叫安全,是这个平台上,那么他和其他的数据库呢, 也可以无缝的跨过检索。那帕曼特呢,其实他的历史是非常的悠久的,他们最早呢,他是一本七刊啊,叫做 indest americas, 他是一本这个纸质的刊,他主要是记载的这些生物医学的这个啊 期刊的题录。那么在一九七年呢,随着计算机网络的发展,那么他就做成了一个连接系统啊,那个时候叫 my 的奈啊,那个时候都是安奈嘛, 所以这迈的奈是最流行的名枪。那么八三年以后呢,为了利于推广,所以吧就把做成了光盘。最近但是说有迈的耐光盘啊,那个时候我们国家的很多图书馆,也有很多机构都能修到这个迈的耐光盘, 那么但是后来的数据由来越来越多,光盘呢,已经无法存储了,那么在九七零的时候呢,我们把就做成那个网络数据库是吧,把它 公开化,免费化,叫 party 是吧?叫 part may, 就是这样一个发展历程,那么直到现在呢, part may 呢,就是一个非常大的一个检索系统,其中这个麦德奈呢,就是其中的啊,非常重要的一个主见。 那我们看一下关于麦当娜他有哪些的构成,这无论我们学习什么数据库,都要去了解这个数据库的一个啊构成情况,他包含哪些类型的资源,那么 啊麦德奈呢,他的最终最主要的资源就是他的一个帕麦的最主要的中原就是他这个麦德奈数据库啊,麦德奈是他的核心,占他所有资源的百分之九十以上, 那么它是由八十多个国家的五千二百多种生物医学的期刊和提溜所构成的啊,这个就是啊麦德奈的麦,麦德奈的部分啊,帕麦的麦纳的部分。第二呢就是 pmc 就帕布 三曲,那么这里有些开放获取的一些生物科学的期刊和作者首考,那么有一些呢,是这个麦德奈维修路的啊,他提供一些全文。另外呢啊帕麦的呢,还修路这个 ncbi 的在线图书的,在线的这个图书的七千五百多种图书和研究报告, 这就是帕麦的一个三大部分构成,还有麦德奈,帕麦的三圈和 ncba 的电子图书,那其中麦德纳呢,占他的百分之九十多部分,所以他主要来说是一个以这个生物医学的期刊的文章和题录啊为主,构成了这样一个数据库, 那么他累积的数量呢?有三千多三千二百多万条文件记录。那么他的时间最早能够回复到一八六五年啊,现在可能更早了,可能是一八一五年了,所以回去的特别早, 那画面呢,他本身呢,呃是不提供原文的,但是呢,他有些链接的原文,如果是有原文的话,他会给你链接过去啊,另外呢在 pmc 中也是有原文的,所以说呢啊,他说有原文的部分是会给你链接过去的。 那帕麦呢,是一个免费访问的,我们直接抄到下面的网址啊,就可以直接输入啊,如果觉得这个网址很长的话呢,你也可以在我们图书馆的主页握文资源上啊,点到这个帕麦的一个链接也是可以访问的啊,无论你用的是什么样的啊,互联网 啊,什么样的互联网的厂商啊,移动电信,联通都好,都是可以免费访问的啊,不需要通过校园网来访问他,他就向全世界免费了啊,这个就是一个啊,拍卖的一个访问情况。另外呢啊,建议大家访问 拍卖的时候呢,尽量去使用啊,我们的火壶也是 firefox 或是呢这个 crom 谷歌浏览器,因为我们很多的国产浏览器啊,三六零啊, qq 浏览器或者其他的话可能会存在一些兼容性的问题,而且呢浏览器呢,一般来说会谈广告是不是还有些啊乱七八糟的隐私问题啊。所以说为了你的最佳的最佳的这个浏览效果,请使用火狐或者谷歌。 这个我一再强调啊,如果你使用 ie, 特别是老班们的 ie 的话,你的画面会撕裂,有些功能会出不来,这个是我们的一个建议啊,那画面的主要构成部分, 帕麦的文献啊,由这四种类型所构成啊。第一个就是麦德奈,我们刚才讲过麦德奈呢,是帕麦的一个主体部分,他占 百分之呃,九十多以上,所以说麦德奈的数据呢,在后面都有个方框啊,叫做 indict for 麦德奈。这,这告诉你他们的这一部分的数据啊,是麦德奈中的数据。麦德奈中的数据有个最大的特点,就这个数据啊,他是被标引过的,他是有主题词啊,有医学主题词部分啊。如果你不知道什么是医学主题词的话, 那么在我们以前的讲课中,以前的视频中有专门对医学主题词的呃讲解。嗯,如果你这点忘了话,再回去看一下什么叫医学主题词啊,这个以后我们还会在随后的课程中,我们还会继续讲啊,如何用拍卖的来进行医学主题词的解锁。 第二种呢,叫做尚未标音主题词的啊,叫做 party, 因为刚才我们说了,呃,以前我们讲过,我说医学主题词啊,是由这个医学专家根据文章的内容 他看过以后,根据文章内容来进行标影的,那么既然是人看的话,他肯定需要一定的时间,那么一般来说一篇文章被修路进来以后,可能需要十五天左右的时间才会被标影上主题词,那么在这个标影的过程中呢, 那么就会有这样一个啊,叫 mpsis, 意思说正在表演中,专家正在看,是不是啊? mpsis, 他大概在十五天过后你就能找到主题词了,那么在没有主题词之前,你当然就不能用主题检索去检索到他了,但是可以用基本检索或者自由式检索去检索到这种文件。所以第二种啊,叫做啊,我正在标影中。 那么第三种呢是帕迈的收入,但是呢迈的迈步收入的这一种,那么这种叫做 star pardon bipobly 型,有初吻商提供,但是呢可能他不会被收入到迈的奈中,为什么?因为 专家的精力有限,他不可能对所有的文章都进行啊,表演对不对啊?另外一种呢就是欧的麦德奈, 你就比较老的一些文献啊,会修了那个会称的欧特曼来卖。另外这个呃撒拍在 party 的出版商提供呢,还有一些就是说跟医学相关度不大的,他也会被称为这个啊撒拍卖 party 选由出版商提供,所以说呢,拍卖的构成基本上只有这四种所构成, 另外呢还有就是 ncba 的图书等等等等啊,他会可能可能会有这个呃,写上这个拍卖的沙拍吧,还有 pop 里形这些。 好,那么在接待会的章节中呢,我们会讲一下怕卖的一个基本解锁 好了,那接下来呢,我们来介绍一下趴麦的这个界面。趴的界面呢,相当的简洁啊,我们只要把这个网址输到这个趴麦的中 啊,新版的帕迈的王子呢,稍微有点变化啊,是帕迈的点 ncba 点 nlm 的 nh 点接微啊,这个老板呢,稍微有一点变化了,那么 我们把它点开以后呢,就是这样一个界面啊,这是一个非常简洁的一个解锁框啊,这个地方可以输入我们的解锁室下面一个高级解锁按钮,点开以后呢,可以进入到一个高级解锁的一个界面。 那下面呢有四个模块啊,第一个呢是关于教程模块啊啊关于拍卖的介绍和他的相关教程。第二个呢是一个发现模块, 包含了高级检索这个临床咨询工具和单元匹配器,那这一块呢我们就会全部的讲到。第三块呢是一个啊,这个我们说的一个应用模块啊,包含了一些多语文匹配器,还有一些 fpp 下载等等功能。那么最后一个模块呢是一 一些哦,他他自己说是发现扩展谋害,其实呢就是医学处理词表和这个嗯, n m m 美国医学图书馆的一个期刊目录, 那么下面呢有这个最新流行的文章和最新的文章啊,一个啊一个推荐,下面呢就是以他的一些相关信息了,这就是一个趴麦的一个主界面的介绍,接下来呢我会讲一下趴麦的一个基本解锁。 好的,接下来呢我们介绍一下帕妹的一个基本检索,拍的基本检索呢就是所以帕妹的基本检索啊,就是在帕妹的的一个 一个主页面上的检索,他们的主页面上这个基本检索框内的检索啊,他看到这个检索框是非常的简洁啊,非常的简洁,他的呃检索规则呢也非常的简 啊,有点类似于谷歌,那么就是首先呢就是一个波尔逻辑,就是 and or 和 not 啊,大家注意啊,它是大写的,它是大写的,那么并且呢在我们的解锁框中啊,在在这个框中的时候,大家输入 and 和 no 的时候呢,是不讲究优先级的,它的解锁顺序呢是直接从左到右 直接送到,这个大家啊要清楚。那么第二呢就是括号啊,括号大家可以用这个括号来改变运算顺序。第三个呢就是新号 啊,新号呢代表零到 n 个字符啊,表示的是可以可以接词啊,可以接词, 比如说啊,像这个开摩菲尔皮啊,这个新号可以把解锁的后面这些啊,这是一个前截词,一个前截词的一个方法,那么最后 后呢就是一个引号啊,英文绊脚,大家注意这所有的都是英文绊脚啊,因为绊脚的引号呢,代表的是一个词组检索,表示哈,我们要强制检索这样一个词组,不能把它分开或者把拆分。 那么首先来看一个案例,比如说我们要检索猫或狗的一个淋巴癌的化疗,拿到题目后呢,首先我们对题目要进行一个分拆啊,找到其中的一个一个逻逻辑关系, 逻辑关系非常简单啊,首先就是猫或者狗 n 的淋巴癌按的化疗,那第二步呢,我们要找找出来这些词的一个,尽可能的找到它的一个啊,一个关键词的不同的表达形式,猫和狗啊就就没什么了。那么往下面看呢,就是淋巴癌,淋巴癌我们看到这里有 非常多的不同的表达形式啊,我们今天把它全部找出来,有的同学想问我,那邱老师你是怎么找到的呢?这里找的几种方法,第一个呢是说我们可以去, 我们可以使用这个搜索引擎来找。第二呢我们可以找用找中文的淋巴相关的文献,找中文文献,然后看他们的翻译啊,他们翻译是如何把它翻译成外文呢?把这些不同的外文把它全部找出来,这样呢就比较全,包括化疗呢,也是以同样的一个找法, 找完了之后呢,我们把这些词全部替代进去啊,猫或狗啊,这是,这是相关的淋巴癌,看到没有?淋巴癌 不同的表示形式,用沃尔来表示,那么这个地方呢?一个词组啊,我们要英文的双引号,把它把它扩上啊,沃尔啊,淋巴癌它最大,这个呃逻辑符前后都是有一个空格的, 大家注意不要把它忘记了啊,忘记的话就出不来了。 and 啊,这个是大家注意到这个地方的化疗啊,我做了一个劫持检索,我们看到这种化疗啊, come of therapy, 那么所有的词呢,其实都是由这个词啊化身而来的 啊,所以说你后面这个 p 后面加个新号,就能代表这个地方的所有的词了,大家看到没有,他们具有一个相同的一个前缀,所以这个地方呢?哎,我偷了一点懒,偷了一点懒啊,开毛 crp, 这样把它全部表示, 大家知道哈,这是结实检索。好,那么这个我们现在呢,就可以把这样一个检索室,大家把写好了之后,把它复制下来,来到拍卖的中啊,拍卖中直接粘到我们的快速检索框,点击四十七按钮,这个地方呢,我们看到 就找到了六百九十四篇文章啊,六百九十四篇文章,那接下来呢,我们看一下检索结果的界面,我们看到找到六百九十四篇文章,那么左边呢,是对这个检索结果的一个筛选啊,待会我们会详细的讲到 这地方,咱们可以看到啊,最早的是一九六三年的,最新的是二零二零年的,这里边有一个随着年份发文的一个趋势啊,趋势, 那接着我们再来看他的一个解锁结果,解锁结果呢,他的一个排序方式是按照 best match, best match 这种方式就是说,呃,最相近的结果啊,最相近界的结果排在最前面。那么这个地方呢,点击 display options, 可以进行一个,可以进行一个,进行那个改变它。那么除了 有这个 best match 之外呢,还可以这个选择 most recent, 就是按照一个最新的顺序啊,最新的文章在最前的顺序啊,也可以按照这个发表时间的顺序啊,这个顺序都是可以,都是可以改变的。那么美业的呢?我这个让美业展现的文章呢,是十篇 啊,那下面可以进行更改,最多呢可以显示每页,每页显示两百篇文章啊。这里展现的格式呢,是萨摩尔格式哦。摘要,格式,你也可以把它改成,而不是 dress 文斋格式啊,这方都是可以改变的。现在我们把它还原, 还不到原了,后退一下,把它还原好,现在就把还原了。我们看一下 这样的一个题录啊,题录,首先呢,第一行就是一个对文章的一个 题目啊,让他题目,那么下面呢,这一行呢?是啊,作者名,作者姓名在下面一行呢,是七开名称啊,啊,连月 七卷啊,五十三卷第三期一百四十七到一百五十三页,这里有个 d u i 号, d u i 号截止到这里 d u i 呢,是我们说一边一,一般的学术论文 他都有个身份证号,他是唯一的,只有是一个 dy 号,大家记住啊,是一个他的身份证号就好了。然后他告诉你的这篇文章是二零一七年十一月十三号出,在一怕我就是电子出版,就纸质版没有出之前啊。二零一三年二零一七 七年七月十三号电子版是优先出版的,那么 pmid 这个是 party 的中一篇文章的一个身份证号,大家也把看的是一个身份证,只不过这个身份证号呢,是 part may 的中的一个身份证号。下面是对这篇文章的一个摘药啊,摘药摘取了一点, 我们把这篇文章点开,点开他就来到这篇文章那个详细的一个页面,我们看到首先呢就是这篇文章呢,还是一个啊,他的七开明 年月卷七页码,身份证号叫 dy 号,他的一个啊,网络发布的时间题目,这里有作者啊,作者, 那么与点开这个 x 棒的按钮啊,可以看到作者的单位啊,作者单位,那么下面呢,有 pmid 就是这样个文章的一个身份证号啊,趴麦中的一个身份证号和 di 号 dii 号是通用的。下面有文章的摘药,摘药下面有与这篇文章所类似的文章的一些推荐。 最下面呢就是 set by 这个文章被这两篇文章所引用啊,背影情况,那么下面呢有 pop 的心态出现。文章的一个 呃,出版出版类型,我们看到蚊香类型啊,那这个地方是非美国政府的一个研究资助文章下面有练习词啊,他的医学主题词的一个一个条目。 这个一些主题词呢,之前我们讲过,如果大家忘记的话,或者没有学过的话呢,可以去翻以前的视频啊,上一期一些主题词表的相关部分,下面有文章中提到的物质,这里有呢相关的一个全文链接 啊, ovid 和 v 里都有全文,那么在右边呢,也有啊,这也是一个全文链接,你点开后呢,就可以链接到可以购买这个或者获取到文献全文的地方啊, free four, 不不不, free 啊,是 for test article, 就是文章带有全文,但不一定是免费的,免费的话这是叫 free for test 啊,这 for test 呢,就是说有全文啊,有全文,那么右边呢,是一个分享按钮啊,那么这里有个页面节点, 点击相关的,比如我要看尾线类型,你点到它就可以跳转到相应的节点中来啊,页页面的一个导航,这就是啊,我们所说的啊,拍卖的一个结果的一个呈现界面。那现在呢,再回到我们的这个基本检索的检索室中来,有东西 可能会问我,老师,你在这个地方输了检检索室啊,输了这一块并不是我们之前提提到的意义上检索室,为什么呢?说这个地方只有检索词和逻辑符,那他相应的字段是什么呢?这里没有字段,我怎么知道检索的是什么呢? 其实哈啊,大家表面上看到这个基本连锁是非常的简单,我们没有输入任何的阶段,就像谷歌一样。那么其实呢,帕梅在后台呢,其实已经帮你智能转换了,这种转换呢,在帕梅的中有个相应的解释,叫做自动词语匹配。 有人说说我们输的词啊,虽然我们输的词很简单,但是系统在后台其实做了大量的工作。我们举个例子啊,比如说我们现在输一个 a i d s 啊, a i d s, 我们进行解锁,他看到我们输的词很简单, 也没有带有任何的自断,也没有输入他的一些,输入他的一些啊这种呃相应相应的不同的表示方法。但是呢我们看一下系统其实在后台做了大量的转化,我们点击高级解锁,这里耳朵望式按钮,我们来看一下系统做到哪些工具。 这里是高级解锁的一个界面,我们看到啊啊,这里呢是一个高解锁框啊,高解锁框,那下面呢就是一个解锁系的呈现的一个区域,那下面呢这个地方有解锁历史,我们之前解锁的所有内容都会在下面地方呈现,那么最新的一个解锁呢,就是我们输了 aids, 表面上我们输入是 aids, 其实上呢我们可以点击这个网 dtl 的按钮,点开,我们看到系统呢其实对这个地方做了大量的一个运算, aids 其实系统已经把它转换成了一个医学组 一次,另外呢还把啊这个 a id 和 s 啊, a id 和 s 把它进行了一个全部的一个转换啊,应该是 a 啊 id 和 s 啊就是获得性免疫缺陷和综合征 进行转向他的,他的检索自断是全全部自断。另外呢还把我们这个词啊这获得性名综合征在全自段中进行了检索,最后呢还握上了一个 aids 这样一个词,所以说系统其实做了大量的工作, 但是有些东西说老师,那既然这么简单的话,以后我们是不是全部都可以用智能解锁,愿意看到系统会自动进行转换吗?啊,这个呢也不一定啊,因为自动解锁大家可以看到自动解锁他首先保证的是我们解锁出来的文献 多,所以他基本是在全自段中进行检索的,这样虽然检索非常简便,但是呢会造成我们检索的精度非常的低,比如说检索出来内容非常的多啊,漏肯定是不会漏,但是呢检索出来的准确度很低,准确度很低, 所以说呢,在后面过程中呢,我们还要尝试的利用高级检索和主题式检索来手动的构建,光使用这个去依高度依赖这个智能是不太好的啊,这个是我们讲的啊,这个我们所谓的啊自动词语匹配功能,那像我们看那个案例, 比如说我们要检索阿司匹林预防心脏病的稳健,阿司匹林就这心脏病,他的 attack 和微型,那我们应该怎么来检索才最好呢?就是我们如果用这个基本结束的话,怎么来检索呢?第一种 方法啊,用引号引起来阿司匹林 for head attack preventing。 第二种呢,直接阿司匹林 hard attack province。 第三种呢啊,我们把所有的词都拆开,然后用 and 来连接,哪种更好一点?同学们,一二还是三, 这地方呢啊,大家先思考一下啊,首先呢,我们应该排除一,为什么排除一呢?大家注意到一这个地方前后都有一个双引号,英文半的双引号,那么在解锁的时候呢,系统会把这个东西当成一个整个的词组来解锁,只能说这一个整个词 只有这一串啊,他的次序不连不中断啊,这样连续出现才会被检索到,这样对我们的解锁来说啊,是非常不佳的,他啊,他会影响我们 所的精度,所以第一个是被淘汰的,那我们再看二和三之间的区别,二和三这种区别就是中间加了个 and 的。 有人有些同学们说,老师你不是说了吗,啊,词语要分开是吧,所以加按了三是没有错的。那么其实呢,大家注意到 hot attack 啊,其实作为一个词组,我们应该把它一起来用,对吧?心脏病啊,心脏病发作, 而你把它中间加了一个按的以后呢,系统会把哈的和盖强行的分开,这样造成我们那个解锁的一个偏差。 所以说,如果这个地方啊,没有哈达 ik 和泰克,中间没有这个 n 的话,我们用第二第三个是可以的啊,而且呢,检索进度还还会还会很不错。但是由于呢,这里画蛇添足,多 多了一个 and 啊,多了一个案子啊,所以说呢,这个地方的效果并不好。所以说啊,我们第二种方检测方法应该是最合适的, 大最大,这就是在自动词语匹配的时候大最大。如果大家要加按的,尽量在一个概念后面一个词组后面来加按的,不要把这个词一个词的概念啊,强行把它分开,这样反而会起到一个相反的一个作用效果。 这三个呢,大家可以下球自己去尝试一下看一下,呃,自己演练一下,看他的检索到底会有什么区别。 可能有的同学又要说,老师你刚才捡的这个猫和狗的林白的化疗,这个简属实太长了是吧,我可能一时半会写不出来这么多,然后呢,我要修改的也很麻烦,能不能把它分布来做呢?这个时候呢,其实我们可以使用哈卖的一个 一个高级检索功能啊,高级检索功能我们直接刚才我们已经进入高级检索了哈,大家再给他演示下怎么进,直接点击主页面上的额头望视按钮就可以啊, 那么进来以后呢,就是这样的界面,其实我们可以把我们刚才解锁的内容分布输入到解,输入到解锁框中,然后一起来主配,那么具体的是这样子看一下, 首先啊,猫或狗这是第一步啊,把它直接窝非要的竖在右手框,因为这个地方我们使用的还是巨龙主配,所以用的窝非要是没有问题的直接添加添加,那么接下来呢,把这个淋巴癌这一串啊,淋巴癌这一串 添加,由于是按的关系啊,所以我们这个下拉菜单啊,直接点击按了就可以了,看到没有,这下面就生成了。那么第三步呢,就是这个的 所谓的化疗啊,化疗同样也是按的进去,那么最后呢,我们来点击解锁按钮, 我们还有检索的结果是一样的,同样是六百九十四篇文章,所以说呢,对一些啊,稍微复杂一点的检索呢,我们可以使用啊这个高检索的方式, 同时呢交易检索的一个下拉菜单,我们可以看到还有不同的一些字段可以可以供选择啊,所以说呢,你除了用窝非要之外呢,你也可以,比如说我只想用标题行不行呢?也是可以的是吧,只用抬头或者用标题和摘药,同样也是可以解锁的, 这个是高元素的方式,这个地方呢,由于还是比较简单,所以说呢,我们就不再深入展开了, 有的时候啊,我们也需要在拍卖点中去检索某个作者的文章,这个时候呢我们就要需要使用到 做的检索,那么首先注意注意到是那么对于帕麦的中作者应该去怎么去表示他作者名,那么其实很非常简单,大家记住啊,那么无论是中文的作者,中国的作者啊,就中文名还是外国名, 大家一定要注意到这样一个原则,就是信在前,名在后,信用全称民用缩写啊,大家记住啊,信在前,名在后,信用全称,民用缩写。那比如说我们要检索啊,这样一个人啊,安东尼 s, 福奇啊的文章啊,这是最近的一个热门人物, 那么右边哪个是正确的呢?我们看到福奇应该是姓安东尼和 s 啊,安东尼是他的这个名啊,这个 s 呢,应该是他的 medal name, 所以应该是中间一个, 他们应该怎么来表示呢?如何来表示? 那么按照我们的信在前,名在后,信用全枪名在缩写的话呢,我们应该用中间这一个才对,对吧?用中间这个对,我们可以直接啊,如果要解锁他的文章,可以啊,直接在在他的主页中输入啊,这样一个人名啊,这是可以的啊,可以直接这样这样子做, 那么你也可以怎么办呢?你也可以在我们的高级手中啊,点开下拉菜单,这里有个作者啊,输入这样子也是可以的啊,也是可以这样也可以, 这样也可以啊,那么第二个呢,我们要讲的是这个七杆减锁,七杆减锁,现在我们讲七杆减锁,那么在旁边的减锁七开呢,有非有几种方式可以 来检索?第一个方式呢,就是说啊,直接用七开明来检索,比如说美国病理学杂技,直接啊这个七开明 丢进去检索,这是可以的啊,这个锁可以的。第二呢,也可以用缩写啊,这个也是可以的,也可以的,或者呢直接啊用他的 issn 号,如果你知道七个 sisnn 也是可以的啊,直接把七开明啊, sn 号输入也是可以解锁的。 那这个地方需要注意的一些事情,就是说如果一个期刊啊,他同时是一个主题词,比如说饲料 cancer 这样期刊的话,这样就比较麻烦了,所以我们要需要注意,如果这个期刊本身他就是一个主题词的话,这个时候我们该怎么减呢?这个时候呢,我们可以到高级检索中取啊,比如说我们点到高级检索,比如我们要 解锁 sl 细胞搜索这这样的期刊,哎,我们可以直接找到,在下拉菜当中我们可以找到一个期刊名 abcd 找到切开,然后输入 cear 看到。当然你也可以直接把这个 junof 用括号括在后面,在在这个快速键的方解锁是可以的。 这样呢,我们就找到啊细胞啊这个气杆上所有的类型的文章。所以说大家注意到,如果你的这个气概名是一个主题词的话,这时候我们要需要小心一点,那就用这种方式也是可以的。 好,以上呢我们就讲解了如何利用啊,如何检索作者,如何检索切开。好了,接下 我们来讲述我们在帕妹的章节,最重要的一部分就是利用医学主题词表面系来进行主题检索。 有位同学可能又会问了,说老师,刚才我们用基本检索啊,我们知道有自动词语匹配,已经能找到很多的文献了,为什么我们还要用这样的一个医学主题词来查找呢? 啊,那么原因在于啊,他们的智能检索,他的这个自动词语主配,他讲究的是我们查找出来的文献的一个全他的检索的精度,他检索了一个 你的准确度是非常差的,因为他是默认是在全自段中进行解锁,所以说你会找到非常很多的无关文献啊,为了我们的解锁的准确啊,最好呢,我们还是用面协来解锁,那么他的好处都有,第一个,他可以克服不同的 概念导致的这样的一个拼法,不同的一个漏减或误解,有了它以后呢,我们就不用去找那些非常多的一些无关的概念了,那些同一词不同表示方法,我们都可以把它去除掉。 第二个呢,他具有一个上下位词的一个扩展功能,我们可以用他的上位词去检测所有的下位词,例如说我们可以我们要找所有的青霉素类,是吧,把所有的青霉素的副作用找出来,我们可以只用找青霉素类就可以了啊,我们不用把所有的青霉素全部卧起来。 第三个呢,他可以支持一个副主题词,一个限定啊,利用合适的副主题词,这样呢,我们可以做到一个能够使啊我们的解锁的更加的专职啊,更加的专职。另外呢,我们可以利用一个加权功能,我们用主题词的加权还没找到 以这个话题或者以这个主题为主要内容的文献,使我们的检索啊,更加的专辑找到了,文章更加的精确,这就是我们说利用面洗查找帕美的一个优点。 好的,那接下来呢,我们看下面一个主题检索的案例,我们要检索心肌梗塞引起心脏破裂的一个外科手术的文献。那么这道题呢,我们在之前的啊,上一章节的中国生物学文献数据库呢,已经讲解过,现在我们再来复习一下, 我们看到这边有三个概念,心肌梗塞、心脏破裂和外科手术。那么其中心肌梗塞引起心脏破裂呢,我们又叫做梗塞后心脏破裂,我们后来我们检索,我们会发现,其实呢,这个词他有一个词可以表示他的就叫心脏破裂,梗死后, 对不对?第二个呢?外科手术,那这个地方的外科手术不应该作为主力词来检,因为这个题目呢,他讲的并不是外科手术本身,讲的是心机心脏破裂的一个外科手术,所以说外科手术呢,应该是作为副主力词来检索的。 好,首先我们拿到题目,分析完题目之后呢,我们遇到第一个问题就是用,就是要来翻译这个题目, 你有的同学说,老师,那我是不是可以用这个谷歌翻译或者百度翻译这种工具来翻译呢啊? 或者说我如果知道一些工具书,当然你如果知道一些工具书,或者一些英文医学词典,你翻译是没有问题的啊,用这个谷歌和百度翻译呢,也没有问题啊,但是有时候呢,会存在一些误差啊,比如以这个百度它 翻译这个啊,心脏魄力有时候就会翻译错,比如说心脏魄力,他可能会翻译这哈德波尔克,如果翻译成哈德波尔克就比较可笑了,对不对?哈德波尔克一般只是这种情感上的,这种心心心碎啊,那些和这个地方心脏破裂就不是一码事了,对不对啊?你说去表白 被拒绝了,你说哈的 break 是可以的,但是你不能说去表白被拒绝了,结果心脏破裂了,这样不好了,是不是?所以说啊, 最准确的一种翻译方法是什么呢?就是利用我们之前所学的中国生物学文件数据库,为什么用它是最好的呢?因为我们知道中国生物学生术它有这个医学主题词表的这一个翻译版,它是本来是从英文翻译成中文的,我们现在可以把它翻译回去,那么这样呢?是比较 准确的。那么中国新闻型数据库呢?目前哈他是有一个免费账号的,我们可以直接在疫情期间可以用这个账号来登录,这个是免费的啊,我不知道免费多久,可能以后就不免费了啊, 当然如果不免费,大家用一些翻译工具也是可以的,但是用它呢?更好一点。我们点击文学解锁中的中文解锁,点击主题解锁。首先我们来找第一个主题词,就是这个心脏破裂梗死后 梗色号,心脏破裂就是心肌梗死引起的心脏破裂,所以我们用这个线组词哈, 那么下面我们可以看到这个词的一个英文名称啊,那这个地方呢?为了演示方便啊,我只只复制一个哈瑞 pose 啊,这个前面这一个。 那现在呢?我们来到这个趴麦的中啊,趴麦的主页 点击下面的这一个啊, mash 给他 base, 没给他 base, 由于比较慢啊,所以我就嗯之前把他点击点击好了一个啊, 这时候呢,在我们的解锁框中输入啊,心脏破裂,点击解锁按钮,这可以,这个时候我们可以找到跟心脏破裂比较相关的几个主题词,一个叫心脏破裂,一个叫心脏破裂梗死后,一个叫心脏损伤,那最大,我们要选择 心脏破裂梗死后,对吧?这一个才是我们想要的,我们点击它, 点击他以后,我们可以看到这就是心脏破裂梗死后的一个主题词,下面是对他的解释, 是一九八七年被引入,一九九一年被修修定。下面呢,这一缺啊,是可以所有和他主配的副主席吃都在这个地方啊,这里,这里没有七十八个,这里只是说可以和他主配的把他列下来。 那下面呢,有他的入口词啊,这里是他的啊,数量结构表的一个一个序号啊, c 幺四。那下面呢,有一个他的入口词,也就是说他的同一词啊,他的不同的表达方式都在这个地方啊,作为他的小名。那最后呢啊,有一个数量结构表, 你看到心脏破裂的梗死后的上位词叫做心脏破裂,他还有个儿子,一个下位词叫这个应该是时间隔破损,对吧?大家看到这是他的双节奏表,好,我们看到,那这个呢,我们在 在复读的词表中,我们要选择什么呢?选择外科学,点击它,下面还有两个按钮啊,这两个按钮呢,第一个叫 restrict you mash major topic。 啊,这个什么意思呢?就是加权的意思啊,限制为加权。 那这个地方呢,我们待会再来讲他,我们先把这个这一套流程先讲完。第二个呢叫做 do not include mesh terms find below this term。 据说这是一个不扩展的按钮, 不扩展,这两个我们待会再讲。好,我们先勾选上了,这个时候我们先不加群啊,这个的我们两个先先不点他,勾选他了以后,我们点击右边的添加到解锁框, 我们看到心脏破裂啊,斜杠外科学啊,外科手术面型,这表示呢就是我们新型的主力检, 而且呢面型的表示就是一个不加全的解锁啊,点击 starch parmade, 我们看到啊,这个时候呢,我们找到了八百四十一篇文章,八百四十一篇文章,我们随便点开一篇,我们看一下它的结果是什么,如何被检索出来的。 这是其中的一篇文章啊,是一篇中述啊,这里是带免费全文的,我们可以在下面啊找到他的一个主题词的一个选项,我们看到这里就有啊,心脏破裂梗死后,外科学,这里啊,就是我们要检测内容, 心脏破裂刚止到外科学啊,这个,这个呢,这个是谁给的?这是作者给的吗?这个并不是作者给的啊,这个是我们的标影专家对文章的内容进行 查看了以后啊,他写在后面的啊,心脏非得跟上,这是对文章利用的一个表示,这就是我们的处理检索的一个步骤啊,这个这是一个非常简单案例,给大家主要检 介绍这一块。那么接下来呢,我们来讲一下刚才我们遗留的问题,就是这个家权是怎么一回事, 那么家权是怎么回事呢?在我们文一,一般啊,一边弄,文中可能会讲到很多的疾病,或者很多的症状,或者很多的一些 化学物质,但是一篇文章他总是是会有一些重点,会有重点,那么哪些是文章的重点呢?那么重点内容应该怎么表示呢?我们来看下面这个案例,这里有两篇文章啊,这两篇文章是我,是我编转的哈,可能并不存在这两篇文章,一篇呢叫做利用纳米福地来 治疗 ads 一百粒,其中呢有十粒同时换又乙肝。那么看到这篇文章的话,如果把它标引上主题词的话,应该怎么标呢?首先他讲了一个拉米菲的一个质量应用, 然后呢他讲一个获得性免券中的一个药物疗法,同时呢他还讲到了一个肝炎隐形的药物疗法。我们再看另外一篇文章,这文章呢啊,那么就有点 不一样,我们看到纳米福鼎治疗乙肝一百粒,大家注意到啊,这个地方和上面的不一样,其中呢实力患有艾滋 啊。我们看到这两篇文章最大的不同就是侧重点的不同,第一张侧的拢在于治疗艾滋上,乙肝呢只是附带的。第二篇的侧重点呢,在于治疗乙肝上,艾滋是附带的,所以说,但是大家看这两篇文章的主题词字段是不是一模一样的 啊?所以说止于尺寸,在这个地方我是无法判断判断出我们文章讲述的重点,所以说我们现在引入一个加权的概念,将文章的主要内容啊,用一个新号来表示表示加权。 那么第一篇文章讲述内容重点是什么呢?应该是纳米妇人质量应用和艾滋的药物疗法。那么第二篇的文章的两个重点呢?应该是纳米妇人质量应用和肝炎的药疗法。那么这就是加权的一个作用,我们通过加权就能看到文章的主要方向是什么。 好,那么回到检索中来,那么检索中加权会造成一个什么样的状况啊?那么对检索中的加权,那么就会检索出指以这部分的内容为文章主要内容的文章,那反映出在检索结果将是 解,解锁结果中就会是我们的什么解锁的数量,解锁他的结果的数量会变少,而他的相关度呢,会大幅增加,就是这样一个意思。那么第二个呢, 下面还有个按钮叫做不扩展啊,就 do not 的 include 是吧?不扩展。那么一般来说啊,我们检索心脏破裂根层会连着时间隔破损一起检索 啊,这是检主力,是检索的扩展性,如果把它勾选了以后就只检索他,而不检索他的下维词,所以一般这个这个功能是关闭的啊,大家不要去管他在主要呢是检索这个主。呃,这个加权检索的按钮。好,现在我们来演示一下,我们把它勾选上来后,再来把天涯的解锁框, 你要刷新一下啊,不用刷新 上,我们看到。那么检索呢?变成了啊,心脏破裂根的时候匹配附属于是外科学这段变成了从面系变成了 majer, 代表是现在是家训检索,我们再来检索一下结果,我们看一下检索结果是多少, 我们看下刚才的结果是多少篇,我们在检索利息,我们去看一下 刚才的检索结果啊,现在结果已经出来了啊,已经出来了,现在结果是五百九十二篇,而刚才呢,刚才是八百四十一篇,我们看到检索结果是大幅的减少了啊,那么检索的精度呢?应该是增加了,这就是加权检索的一个意思。 那么接下来呢,我们演示一下多概念的一个脉系减速。刚才我们看的刚才这个案例啊,心肌梗死 引起心脏破裂,其实呢,只有一个主题词,那么如果,如果指的词比较多呢?那是个什么情况呢?那就是你看下面这个案例啊,学透析治疗肾衰竭啊,那这个地方呢, 主要概念有两个,血液透析,同样哈,我们还是啊,利用中国生物秀文献数据库来查找主题词, 主题词,血液透析,那么他呢?所对应的主题词应该是渗透吸啊,那么是第一个词,我们把词找出来,渗透吸,那么回到深入脉的中啊,帕脉的中来啊,是的,帕脉中来, 让我们在每个词表中输入渗透吸这个主力词,那么渗透吸啊, 对应了这个主题词,找到以后, 肾透析啊,肾透析,用,用它来治疗肾衰。那么肾透析对应的主题词呢?就应该是治疗应用,治疗应用, 治疗就不对了啊,但是治疗应用这一个,那这个地方我们加不加全呢? 因为这个血液透气治疗肾衰竭,这是种非常常见的一种技术,所以说呢,呃,而且我们以前用中文检索的时候,我们会发现文献出来的特别多,是吧,所以说其实是可以加权的,我们加权吧, 因为我这边有把握啊,我这地方是有把握,因为我知道会特别多,所以才加球。那么对于一般的同学,我们在初次检索的时候,如果你对这个题目不太清楚, 不知道他的解解锁结果到底有多少,那么在初次解锁时候,我不建议加群这张是因为我对他知道应该是特别多的,这是第一步啊,解锁那么渗透系的质量一用啊,我们首先先解锁,哎, 好让他这两天网速有点慢啊,大家都懂得起,我们先不管他,我们再来看第二个肾功能衰竭,让他自己先跳转 查找肾功能衰竭啊,他见肾功能不全,我们找到这个词, 然后呢,我们再往回退啊,退到主题词的解锁界面,找到生功能不全, 找到以后, 那么匹配副主义吃什么呢?有人说,老师匹配血液对不对啊?匹配血液不对啊,你,你这个血液这个主题词是不能用的啊,你不相信的话,你来可以看一下这个地方的,这个地方 c 罗麦的中对血液的解释, 那么他讲的是表明血中的物质或血液中的成分啊,分析血液这个物质的变化 啊,还包括于诊断这些的啊,用诊啊,不,不包括诊断,不包括雄性诊断去阴穴, 所以他主要是用于表明血中的物质和存在的,所以不应该用血液这个附着去吃啊,我们应该还是用治疗就好了。用治疗 这地方呢啊,由于我们知道他比较多,所以我们把它加全这里,这地方应该是没有的。添加到解锁框,点击解锁 这个地方呢,乔老师是把这样一个课题把它分成了两部分,单独解锁哈,那么在有些教材或者是有些视频中,那么他们是把这个东西把它在这个地方啊,在刚才那个框框里,把它框到一起以后加到一起有一起解锁,那么这种 这种检测方法邱老师不推荐啊,我建议还是分布啊,把这个把这个主题词单独的拿过去检,然后呢出了检索结果,然后呢?然后到额头望实中这个地方找到检索利息,这里是肾透析治疗应用,这里是肾衰竭药物啊,这治疗都加了全 在这个地方啊,我们把它加进去,为什么说要单独检索呢?因为我们在真正的检索过程中,特别是比较长的一种线, 那么有可能检测出来的结果为零,或者出现问题的时候,那么我可以对当个检测室进行进行修改,而你一下子把它全部做完以后,检索的时候,在修改的时候就会很麻烦 很麻烦啊,通过单个的检索后呢,我们可以看到他的检索的检索的检索的这个结果有多少,这样呢便于我们修改结果啊,所以说啊,大家这个 饭要一口口吃,路要一步步走,检索呢要一步一步的来啊。我建议大家对初学者而言啊,一定要把这个概念啊,分开了以后单独检索,然后再合并,那最后呢,我们找到了三千九百 八至七篇文章,看我们加权以后都还有这么多,对不对?好,我们随便点击一篇来看渗透析,肾功能衰竭,那么我们可以找到他的, 在这个地方导入主力子之段啊,是肾功,肾功能衰竭慢性啊,治疗看到没有,肾功能,肾功能衰竭的慢性是肾衰竭的一个下位词啊,所以说这个地方是用的这一个,另外呢是肾透析的一个 副作用,副作用呢是治疗的下维持,所以这个地方是匹配到的啊,所以大家看到我们检索的是 肾功能衰竭的治疗啊,这里呢是呃渗透系的质量应用,那下面呢,其实是有变化的,大家要注意变化啊, 肾透析的副作用,他治疗呢变成了副作用,副作用是治疗的下维持,这里肾功能不全啊,慢性肾功能不全是肾功能不全的下维持,所以这个地方有些变化,大家一定要注意,这个变化从哪来的啊?那么这两个甲醛是带着的, 所以说所以有时候不完全一样,你要注意到他是一个上下未迟的一个变化。好,那么这个案例呢,我们就讲到这里。 好,同学们,刚才呢,我们讲解了,通过以上的案例讲解了啊多个主题词, 在利用麦吉词检索时候的一个技巧和方法。那么接下来我们讲一下在帕麦的中啊,一个文献过滤器的一个使用,那我们在我们检索中呢,像有一些文献是带有一些特征词的啊,比如像文献类型, 时间啊,还有一些物种语种啊,年龄啊,性别等等。那么像这一部分呢,我们要通过文献过滤器来进行来限定, 那比如说啊,像这样一个案例,老年人急性阑尾炎穿孔的相关文献,那么其中老年人呢,就需要来限定的。好,首先呢,我们把急性阑尾炎穿孔啊,他的帕麦的检索给大家找一下,首先是急性阑尾炎啊, 我们在我们还是利用中国生物学文件数据库来检索,我们发现啊,并没有一个词啊,叫急性阑尾炎,那么急性有没有相关的主题词呢啊,我们可以找到有一个 急性病啊,急性病,所以首先呢我们来找这个急性病这个主题词啊,急性老板炎,他也是种急性病,这个是没有毛病的,所以说肯定 是没有问题的啊,好的,首先呢我们先找一个主题词啊,急性病, 大家可以在下拉菜啊,这个地方在主页啊,在主页啊,那些在他背时中找到这种啊,急性病找到, 那么由于这个地方概念比较多啊,即兴阑尾炎窗孔还加老年人,所以这个地方呢,我们就副主席就展示就全选啊,因为我乔老师并不清楚当时检测出来的文件数到底有多少啊,所以说副主席就展示,先不要勾选, 特别是这种多概念,并且是我们初次解锁的时候,不要限定的,太死了,好,急性病,第一个主题词好,第二个主题词,阑尾炎,阑尾炎这个词记不住啊,记不住,还是 翻一下吧,这样一个词啊,阑尾炎啊,我们回退一下,在这个页面上找到阑尾炎, 阑尾炎。第二个词,如果要选副主题词呢,应该选择阑尾炎的一个并发症,是吧?阑尾炎并发症吗?这时候我们暂时不要选, 同时这个地方我们还是遵循的前列个原则,就是啊,一个主题词一解锁,不要不要,最后不要放在一起剪,这样一起剪的话呢,可能会 造成了一个,哎,全部都在这啊, 发动机剪啊,到时候出了问题不好调整,不好调整, 所以说呢,窗孔大家注意到啊,有个主题词呢,叫长窗孔,阑尾炎就是长疮孔是不是?所以这个是没有毛病的啊,阑尾炎造成的穿孔肯定是长疮孔嘛,然后炎疮孔就是长疮孔,所以我们找到长疮孔这个主题词,找到 如果要强行选副主题词呢?长穿宠应该选择副主题词,病因穴应该选择病因穴啊,在哪? 这个对吧?由于其他的病造成了一个拉一个长的窗口,当然我们这个地方还是不选也不要加全 好,这样呢,我们就将这个地方的急性病、阑尾炎和长疮孔三个全部搞定了。搞定了以后呢,现在我们到我的望室中去,高研索中去将急性病、 阑尾炎和长疮孔三个按了起来,那个追到按了起来啊,追到,我们看到我们是分开解的,再次强调啊,分开解锁,点击设置器, 我们找了三百七十六篇文章,现在我们限定老年人啊,我们看一下这个地方都有哪些限定条件。第一个是年代限定,这里有个年代限定啊,拖动这个图标就可以限定了,直接拖动他,比如说我要找近近十年的,近二十年的我有拖到二零两千年来。 第二个呢是带是全文选项,第一个是代文斋,第二个是免费全文,第三个是全文,比如说我要勾选免费全文的,我会勾选 free for test。 那么近二十年的免费全文这里有多少片?这里有十八片,对吧?第三个呢啊,就是带有带有 这个啊,负担目录的啊,负担目录这个我们展示先不看呢。第四个是阿迪 que type 文献类型,比如说 k three pose 病例报告,比如说临床实验灭了分析,这里有什么随机对号实验,这里有中速 review, 这里有系统中速,对不对?但如果需要更多的文项类型呢?我可以点击这样的一个 dc no flitters, 这种有个筛选,我看到阿迪狗 taps, 这里还有更多的文献类型,看到没有?还有这么多可以勾选,比如说我勾一个,这一个勾了以后呢, 这张就多出来,多出来一个,我看还可以再进行再一次的限定。好,那下面呢,有时间一年内,五年内,十年内啊,这张是可以,这个出版时间下面有个 long 位置啊, long 位置,那么这个其实我这段写了个 英文啊,他其实还可以勾选其他的文章,其他的语种,这样可以勾选啊,这个是勾选点击后让他让他出现,比如说有没有中文, 然后就可以勾选性别啊,这里也是可以的啊,在这里可以进行进一步的限定,那我们要找到年龄对不对,老年人以上,我们点到这 a 级,这这里就有老年人六十五岁以上,点击绣。然后呢我们勾选一下 这个地方呢,其实我的这段限定条件还比较多,限定了免费,全文限定了最近二十年啊,限定了一个老年人,限定老年人啊,这里也最终,最终呢只剩下了七篇文献。这个地方给大家演示的就是说啊, 这个左侧的一个 pm 的过滤器的使用啊,那么一般来说快速的过滤器在这里,更多的呢,在这帮瑞塞啊,这瑞塞塔点错了,在这里呢,我迪新诺福利特斯。 那么在下次解锁之前,那记住哈,点一下这个 reset 啊,以免下次解锁的时候呢,还会带着相似的解锁条件,一样的解锁条件会影响下次解锁的这样一个结果,一定要记住 reset 在下次解锁之前。 好,那我们呢这个文献过滤器就讲到这一部分,讲就讲完了,那到现在呢,我们的 利用练习主题词进行拍卖的检索呢,就讲的差不多了,现在我们进行个整简单的总结啊,利用练习进行检索的一个步骤,那么第一步呢,就是做所有 检索的一个通用的步骤,就是分析提议,找出检索概念,将检索词啊全部把它分成,不能够再细分那个单词。 那么第二步呢,就是说我们要进到帕妹,进入 c 罗妹的中来查到主题词,为什么到 c 罗妹的呢?那是因为我们为了查找主题词的一个英文翻译,对吧?啊,当然呢,这一步也可以省略,如果说 你知道这个主题词它的英文主题词具体是什么,或者是你用其他的翻译工具来解锁也是可以的啊,也是可以的,所以说不一定是一定是进入 c 罗麦的,但是我们这方推荐的工具啊,是 c 罗麦的, 那么查找到主题词,而且呢我们要找他和他相相匹配的副主题词,那么这个步骤当中呢,我们要注意到我们以前讲过的一个 副主题,主题词的一个主配优先级,是吧,我们可以去参照以前的视频啊,在医学主题词表中,我讲过主题词他的搭配如何搭配啊?搭配的优先级的原则, 那么第三步呢,就是说将这个英文啊,主题词英文,把它粘贴到这样的一个麦帕布麦的这个词表中,确定其英文主题词和他的副主题词,那么第四步呢,要勾选上副主题词啊,那么然后呢,在这一步呢,我们要想一下是否需要加权, 哎,哪些时候需要加权呢?是说不需要加权的,这个没有一定的啊,这个没有确切的说法啊,那么一般而言啊,邱老师说的很清楚,就说你如果是初次检索,而且检索概念比较多的时候,那么你建议先不要不要不要加, 那么主副主题词呢,也建议不要选的太细,因为你初次结束是一个初筛嘛, 然后在你的检索结果中呢,然后再进行慢慢的调整啊,逐步的调整,最后呢来确定是否甲醛。就算邱老师这样从事检索十多年工作的这样的老手来说,也也不能说我一次就把这个检索师全部都给你定,可能也要经过看我的检索结果呢,慢慢慢慢来调整, 所以这个大家是千万不能着急的啊,我们得先系先出再系是吧,先抓大啊,然后再慢慢的把它细化,这样的慢慢的查找, 那么添加连锁解锁框以后来进解锁啊,这个是呢,我推荐是分布解锁,对吧?一个词一个词来,不要眉毛胡子一把抓,根据解锁结果呢,我们来调整我们的解锁策略。 好,如果是概念比较多的啊,有三四个主题词,那就重复二到五的步骤啊,一个一个全部添加进去,那么全部添加完了以后呢,我们进入高检索,对这个检索历史里面啊,把它进行按的,我说 no 一个,这个一个主配操作,把它给主配起来, 那么如果这个里面有些特征词,比如什么老年人呢?比如说需要什么免费全文啊啊,或者调整需要调整时间啊,或者对研究对象有限制啊,就刚才我们讲的那些,那么在检索的结果的左侧啊,进行一个检索结果的一个限定, 那么如果检索结果太多了,那么进一个缩减操作,就说我以前可能偏向于查全,检测出来结果大几万条,现在我要把它, 把它固定到啊,把它缩小到几百条或者几十条,那么请进行缩减,如果过过过少呢?进行扩减,那么缩减和扩减基地怎么操作呢?啊?那就是啊,接下来我们要讲的茶泉与茶准的部分, 那在拍卖中如何查全或者查准,或者换句话说如何缩减和扩减呢?我们看一下左边啊,我们看一边就可以了,那右边一边呢?其实是个反操作, 那么左边呢,其实就是一个啊扩减操作,比如说我们解锁结果为太少或者为零的时候,我们要解锁结果变多的一个操作,怎么来做呢? 首先你可以删掉一些线条件,因为有些线条件他并不是很重要,对不对?你可以把它给删掉啊,就删除一些用按的连接的不重要的减速词。 第二呢,增加些同义词,用卧连接,对吧?增加些同义词啊,然后呢,多用一些减锁符啊,节词符啊,如果不是用的这个麦系减锁的话呢,我可以多用一些节词符,比如说你新号是不是 刚才我们看,刚才看之前我们检索的这个化疗的,是吧?我用了一个 kimocrap, 那个后面加个新号,或者呢取消加权。 以前我们要找检索以他为重点的内容,现在我们不找他,以他为重点,那么检索出来的文章数可能会多一些。 副主题词可以多选或者全选。以前呢,你把它限定在某一个方面,可能限定的太细了,接送出来的文献数比较少,现在我可以多选几个或者全选,这样就会有多。另外呢,用三维词进行解锁,比如说以前我要解锁 阿司匹林治疗胃溃疡,或者阿司匹啊,不是阿司匹林引起胃溃疡,是不是或者阿皮阿司匹林导致十二种溃疡相关文献。那么现在呢,我可以把它用它的上位置吗?是吧?十二指昂溃疡或者胃溃疡的上位值,这个消化道溃疡是不是用它上位置来减,会减走出来更多 啊?所以说啊,用上位词可以检索到所有的下位词的啊。另外呢,我可以增加一些检索之段,比如说以前我这种标题中检索的,那我现在可以用什么?我可以用标题或者关键词吗?或者标题或者摘要吗?这样检索出来的是不是要多一点, 或者我用全全部自断嘛,这样就更多。以前我检测都是十年内的,我现在可以检测二十年、三十年或者不限年份,这样呢都可以保证我这个查全率,就是说换句话说能够扩大我的检测的结果,那 缩减呢?大家反向操作就可以了。那以上呢,我们就讲的是查权与查准,或者说扩减,扩减与缩减的一个方法,当然呢,这个并不仅限于主题质检索, 那么在之前的教程中呢,我们讲到了如何用自由词也是基本解锁来解锁泡面的,另外呢,也给大家重点讲述了用主题词来解锁泡面的,那么两者呢,其实各有优劣,各有优劣,那么他的 优力点在哪里呢?其实呢,他们是各有优缺点的。那么用主题词呢,能够在某个这种程度上来保持保证一个差权力和差损力,因为他毕竟是一个我们说一个标准的名称,对不对?同时呢可以力减少他的 上下位,同时呢还可以加权。但是主力词他有他的缺陷,缺陷在于低,他是滞后的,因为一个新的一个事物,他要列到主力词表中,那么其他是有个时间的, 那么这是第一个之后,就是此表的之后,此表更新的之后,对一些新概念,新名称的之后。第二个之后是什么呢?就说 兑现比较新的文章啊,那么我们的标影专家去看那些文章去标影,那么这这个之间呢,起码有两周的一个之后时间,所以说从这两方面啊,一个词标本身的之后,一个是专家标语的之后。 而且呢有些主题词呢,呃,去转换的时候,其实也很难得找到这主题词他的优点和缺点。那么对于自由词而言呢,自由词他的一个优点在哪里?他的优点低于他不需要转换, 你想到什么词,看到什么词,用什么词,而且能解锁一些新的词语。那么缺点在于有些特别是表达不规范的词语,那很有可能你是解锁不到的,对不对? 有些情况是没有办法去检索查查到,嗯,检索到这种保证查权利和查准率的,比如说你检索某个要的一个副作用,你这个副作用就很多,是吧?你用自由词的话,你就不很不很不好找, 但是你用副主题词副作用,你可以把所有的这种副作用全部找的出来。所以说啊,他们两个是或有优劣的,那我们在检索的时候,尤其是查权的时候,有查权的这种考虑时就说我要尽可能查到更多的文献,查全面的进行查找的时候, 这时候呢,我们要考虑结合使用主题词或自由词两种方法。那么举个例子啊,那帕梅牛中来全面查找新冠 的相关文件,那这个如何来找呢?首先啊,我们可以把主题词他的主题词先找到,我们到我们面试,在 base 中,我们先来找他的主题词,那主题词呢,其实就是 covid 幺九 c o v i d 幺九啊,这是新冠肺炎的一个啊,主题词 看到没有?他现在目前还是一个,目前哈,他还是一个补充概念,看到没有?目前他还是一个补充概念,他没有,他没有上升到主题词的程度, 他是二月十三号被加进来的,但是呢,目前呢,他还不是主题词啊,那么这是他的主题词啊,我们注意到他有哪些入口词呢? 这他的入口词又说这些词都可以来表示这个我们所说的新冠肺炎啊,新冠肺炎啊,所以说呢,那如何来查全呢?首先呢,我们可以这样做,我们先把 coy c o v c o v i d 幺九啊,先把它解锁一下, 然后呢我们先到,我们再开一个窗口啊,我们到高检索中去, 我们可以啊,把他的这些入口词与他的同一词啊全部解锁一道 哦,进到好像是老板的界面中去了啊,等一下 我们现在重新开一个窗口吧,我们把它的入口词哈全部解锁一道, 我一个一个来啊, 然后下一个,我用沃尔关系,用的是沃。大家注意到 这个地方呢,我们其实可以偷下懒,看到没有,因为这个啊和这个是相似的,我们就可以只用它就好了,另外我们把这个 数进去, 好,那么这个就不用输了,因为这个刚才我们在这个地方已经输入了啊, 好,全部输了。以后呢,现在再和我们的刚才这一个呃主题词解锁,其这个呃类似于主题词解锁,它是一个补充概念,我们把它给握起来再进行解锁,我们看它 解锁结果数啊是一万五千九百一十八条,这样呢才算完全解锁权,你们看到没有,和单纯用主题式解锁的话,差距还是很大的,所以说啊,就说在某些情况下, 特别是我们要有查权的考虑,比如说我们要查找啊,某一个,特别是我们要做麦纳分析,或者做些呃数据研究的时候,我们要把所有的类型查全,这个时候我们要注意哈,要使用主题词结合自由词的检索,这样呢才能把它完全的查全。 好了各位同学,刚才呢,我们讲到了利用抛媚的进行的基本检索和主题词检索,作者检索,膝盖检测等,那有时候呢,我们在抛媚的中其实就那么想定位某一篇文章啊,并没有那么广泛 的一个文献需求,那这样时候我们该应该怎么来做呢?啊,这个时候呢,我们就要用到哈妹的一个工具啊,叫做单引纹匹配器啊,那么他这个工具在哪呢?就是在我们哈妹的的一这个 fi 的按钮,这啊,有一个 cing go ct cm, 就是这样一个工具, 这个工具呢,我们点开后呢,其实就是一个,我们可以把它认做是一个表格啊, 我点开一下, 你看到啊,这里就是个表格,我们把我们知道的内容输到相应的表格中,然后进行搜索就可以了啊, 他这里包含了有期刊名,有时间啊,卷期起始页啊,企业啊, 起起始的夜马作者的姓名,还有第一作者或者是拉斯奥斯尔,一般拉斯奥斯是通讯作者啊,还有抬头沃尔兹 题目中的一些字母,那我们来看下面这个案例啊,这是一篇旧文,这篇旧文 啊,二零零五年的八月二十七号,有篇旧文啊,在自然医学上面发表了一篇期刊啊,这个地方的九月一号呢,就是二零零五年的九月一号,那么就是李宝剑啊,原中方大学菲亚的李宝剑带领的这个团队啊, 带领团队,那么发表一篇防止杀死疾病特效的 srna 的这个一个研究, s i r e g 干扰干扰核酸啊,小干扰核酸的一个相关的研究。那么如何来找这篇文章呢?我们要定位这篇文章,该如何来定位呢?我们把我们知道的内容啊说进去,首先是题目啊,这个,呃,去看名啊,自然一学,自然一学就是 nature medicine 啊, 修, 下面就时间二零零五,斜杠零九,斜杠零幺 啊,卷七起洗液,不知道不知道是空着,不知道空着。那么接下来看啊,李宝剑,刚才我们讲过,在帕麦乐中,信用全拼民用首字母缩写,那么对于中国 的名字话就是礼保健 bj 就可以了啊啊,那是不是第一作者呢?啊,不知道啊,不知道就先不管他抬头位置,那么标题中还有什么呢?标题中 他这里是一个中文标题,我们还真不知道标题中含有什么东西,可能还有还有这个 srdnra 啊,可能还有,但是我们不知道,不知道呢,先控制这里,那我们先解锁这些资料,这些信息其实已经很多了,我们点击四二七按钮, 我们看到其实就已经找到了啊,李宝剑是吧啊,不管这个地方他原来是是怎么是怎么,名字怎么样子的,在我们截图的时候,只要姓在前,名在后,信用全凭民用缩写就可以了,大家记住 好,就是这篇文章,二零一五年一篇文章只有定位到了啊,以上呢,就讲的就是这个我们的 c t 型 marcher 啊,单引门匹配七零作用,他用来定位我们定位啊,某一篇单篇的英文是非常有利的一个工具。 那接下来呢,我们来讲一下啊,拍卖的中的另外一个工具叫做临床查询工具啊,有的有的翻译呢,叫临临床问询指南 啊,有时候呢,特别是对于我们这临床的医学生而言,有时候我们只想解锁某一个临床问题的一个特定的答案啊,或者临床问题的某一个, 他的治疗诊断啊,愈后,或者是他的病因穴等等等等啊,可能不需要要太复杂的检测是,那么有没有一种比较快速的 方法来查找临床上的相关文献呢?那么其实帕妹就提供了这样一个懒人工具啊,我,我称之为它是懒人工具,叫我们把叫做临床问寻工具,我们可以在帕妹的主页上的这样一个啊,克林头 cuars, 这个找到他,我们把点击打开, 点击打开以后呢,我们先查找一个疾病啊,比如说我们查找这个克罗恩病,克罗恩病, 克罗恩病啊,把他输进去啊,克罗恩病输进去。然后呢我们点击搜索, 我们看到最左边那个呢,叫做临床研究目录,那么这里呢包含了有有五个方向啊啊,病因 学啊,诊断治疗,愈后和临床预测指南,我们选择相应的啊,相应的 选项,就能得到不一样的结果。下面这个呢,有个 scope board 和 narrow, 那么这个地方指的是什么呢?指的是查权和查准,比如说我们看病因穴这一块,我们点击 board 有两万多篇,点击 narrow 呢,那么其实就有多少了? 我没有跳转,就四千多篇了,就四千多篇了。其实呢,这个用我们手工检索也能检索到啊,只不过呢,他是内置了一套检索师来帮我们得到结果,关于临床级别人少,我们适合了用用他来做。 那么第二大列呢,是这个我们称之为系统中速啊,系统中速,有时候我们要去找一些系统中速,我们可以直接在上面来找,那么第 三类呢是医学遗传,遗传学的研究方向的,我们点开我们看到没有,包括诊断鉴别诊断啊,临床啊,描述啊等等等等等等啊 等等等等啊,一些相关的一些啊主题,我们如果要对于这些主题感兴趣的话啊,对于一算一算学的这块主题感兴趣的话,我们可以移步第三列这个来来进行筛选,比如说这个, 这个应该翻译什么遗传咨询吗?啊,我们可以通过这样的一个方法来查找 这个地方讲的就是一个叫做临床问寻目录啊,他其实是一个懒人工具,懒人工具对于我们,对于临床医生来说,没有经济去构建复杂检索室的时候,我们可以用它。那以上呢就 是我们今天怕妹的从入门到精通的所有内容,以上呢是我们的参考文献啊,欢迎大家啊积极的批评,启动今天的课程呢,就到这里,谢谢大家。