如何用tbtool进行多序列比对

朋友们大家好，我们今天一起来学习 t b tools 这个软件平台。首先第一节课呢，我们讲讲如何一步构建 imos。 所谓的一步构建就是说跳过序列的比对，修剪模型筛选，选择合适的系统发育软件， 那么输入序列，输出 m l 数。好，咱们直接开始。打开软件后，在 others phylogenities 中选择一步构建 m l 数。在跳出的 对话框中有上下两个框，上面是输入，下面是输出，那么在上面的对话框右边点击按钮，之后跳出对话框，选择你要输入的序列文件，打开 在 start 旁边这个对话框，检查一下各种参数的设置，那么只需要改动竖行这地方一比例，这样我们可以看到字长。 然后在下面这个输出区域的对话框中，同样的点击右边这个按钮，设置你的输出文件放在哪个文件夹，设置好之后点打开，然后点击 start， 就可以开始构建系统发育数了，然后到你指定的文件当中生成了一系列的文件文件，根据他们的时间可以看到进度。 当系统发音处建建好之后，他会跳出一个对话框，点击确定，跳出一个竖文件，可以保存成图片。 同时呢，在他的生成的文件中有一个重要的日字文件，我们选择用记事本打开 查看相关的重要信息，比如开始的时候，他对序列进行一个分析，其实有些序列是一样的，然后进行比对 和模型筛选，他用的是 model fonder 进行模型筛选，给出了模型的清单，也给出了在 aic 和 bic 标准下最优的模型， 那么在这个模型下进行，使用 iq tree 这个插件构建系统发育数， 首先是抽样五百棵树，然后进行一次数的统计， 最后一字数放在 ctrl 这个文件中，而抽样的数放在 u u f boot 啊 这个文件中。好， ctrl 这个文件我们可以重命名， 为了备份，我们可以以副本重新命名为 m l， 后缀名以 n w k 格式， 这样的话方便我们使用 mega 等软件打开查看， 这样就出来了一个带支持率的系统发育术。 好，这就是我们今天一起学习的内容。如何使用 t p two 是一个软件非常简单的，非常便捷的构建系统发育数。 那么这个文件不需要比对，也不需要我们自己进行模型的筛选，只要输入这个文件，最终输出我们所需要的最大自然数，也就是这个 ml 数这个文件。好，今天的学习就到这里了，朋友们再见。

大家好，这里是生物信息学分析方法的第四期，今天要说的是序列比对分析， 我们主要还是讲他的操作，关于他怎样做一个图，如果你觉得自己论文的东西不够多，就是还有所欠缺的话，你也可以放一个序列比对的作图。大家应该都在论文里见过类似的，他就是这样一个类似这样的一个图， 这个内容是相对比较简单的，如果你说我不想就是为了他去下载一个软件，专门做图这样图的软件，那你也可以使用一些在线工具。接下来我会给大家介绍几个我用过的网站。首先是这个 crystal miga， 你可以直接 接搜索这个，打开就是这样的界面，它算是 e b i 里面的一部分， 它专门就是做这个多序列比对的，打开之后在这里选择这个蛋白质还是 dna， rna 有什么序列，然后把你之前整理好的序列，这个 fast 格式 就里面就是这样的，再把 ip 好名，然后每一条都放好，在这里就上传上去， 这其他的设置都不用变，然后点提交 结果已经出来了，他就是这样的，现在是黑白色的，你可以添加上颜色， 那就变成彩色的了。如果你的序列比较少的话，你觉得这个图已经可以的的话，那你可以直接在这里截图，如果你觉得这个图有点简单， 而且最重要的一点是这个网站他好像不能够调，就是每一行的氨基酸有数量，就是他是比较长条的一个图，就你不能把它做的调整他的每一行的数量，那你可以选择这个下载文件， 这里直接点另存为的话，也不太方便，你直接把它复制下来，这就是一个 ai 能格式的 一个文件，它这格式就是这个样子，把它复制到一个文本文档里面，那待会可以去到别的网站上去美化。那如果你说我觉得这个网站上做的图它比较简单，不符合我的预期，或者你也不想去复制那个序碟，觉得比较麻烦，也可以直接打开这个网站， 就这个 closed w 直接只搜索这样一个词儿， 它这个 logo 很明显啊，你搜到之后就可以直接打开它，它这个也是专门多序列比对的一个网站， 这些格式都不用变，然后在这里选择是分析的蛋白质还是 dna， 也可以从这里直接上传，也可以从直接从这里选择文件，和刚刚的操作基本上就是一样的。 以下的是一些具体参数的设置，那么这个网站出的图他也是比较单调的，所以我们只是需要他的这个网站出的文件，就不用管这些参数，直接去让他比对， 这里出结果特别快，在这些上下都是一些信息，这里是黑白的。这样他这就是一个 ai 棱格式的一个文件，你可以直接点这个， 这个点了之后他就会自己直接给你下载下来。嗯？为啥没弹出来？是因为我已经下载过了吗？ 啊？下了，然后你就把它选另存为，存到一个你书写 的地方，这是这是我之前存过的，然后我到现在我现在这里就不保存了，等到时候做了之后，可以把它保存到一个一个你找得到的地方，然后有了这个文件之后，我们就直接可以去这个网站做图了， 你搜这个 espript， 搜出来之后他可能会出来这个三点零的版本，竟然是这样一个界面，他这个界面先不是做东西的，他是介绍这个网站是干什么用的，看这里是序列比对，这里是他的二级结构的一些可视化分析， 那你在这里点他的功能，把这个分析功能点进去，我们就可以做序列比对了。那为什么要 要在前两个网站去做，去找那样一个格式的文件呢？是因为前两个网站都是自己带着那个 我来蒙成那个对齐的功能的，然后这个网站只是一个作图的一个网站，你从这里也可以直接输入那个蛋白序列，但是那个输入进去是没有对齐过的，那他就是可能会出现一些排版特别乱、不准确的情况。 那你从这里就把它这个等一下，我先让大家看一下它，这里就是让你选择这个 a、 l、 n 的文件，这个文件其实没有什么特别的要求，只是它里面的格式是这样的，这是它的例子，就这样的， 那你在这里给他选择文件选择，我们刚刚做的 这个是从第二个网站上下载的，然后第一个网站上保存的文本文档也把它找到，也可以用，那我们就用刚刚下载的这个文件， 这个这里选择文件，我们就不用管它这个上传的 p、 d、 b 是做那个二级结构分析的，到时候我会在视频的结尾顺便的把它提一下。如果有人想做的话， 以下是它一些参数的设置，这里是它的颜色设置，这个是黑白的，然后这个就是一般的普通的，你们到时候可以自己尝试， 这些是它的纸的格式，选这个 a 四就够了，这些都不用变。然后这是它的字体的尺寸，这是默认的，也就不用变了。这是它一行有多少个氨基酸，你到时 可以可以想算一下大概那个有几行。我现在在这里先设置一个一百吧， 然后底下这个是行距，其他的也不用变，这是你要输出的格式，我一般选一个图片，然后还有 p pdf 格式的，上面这个文件，它基本上选就选了吧，反正也打不开。然后把这些设置好了之后，就可以点这个提交， 他是正在跑，先等一会， 等他好了之后，他就会给你弹出一个窗口，对，你看他弹出来了，这里要注意有可能会出现的问题，就是有时候他不一定能弹的出来，因为这个网站他弹出的窗口 可能会被拦截，这时候你就在这里这些补地方看一下有没有窗口被拦截，如果有的话，你就是解除它的那个限制就可以了。然后这是出来的结果，你把它打开，我也打开一个 pd 服 pdf 格式的， 这个是我没有调刚刚的那些行距啊什么的，然后他就是这样一个图已经出来了，你就可以把它保存下来了。 然后那刚刚说的这些都全部是在网站上我们就可以完成的。那比如说你的序列，它不是这么整齐，它的同源性不是很高，它不是很像，就这些长度 哇，还有包括里面的序列，这些都相似性特别低，那可能会出现长短都不一样这些，那你可能需要去软件上裁剪一下，那还有这个 m、 e、 g、 a， 就按照之前的那些新建一个序列比对，这些过程都是之前的视频讲过的，然后选择你要分析的序列，从这里给它上传， 把最后一行删掉，然后给它对齐。啊，对，要全选， 选择全部，然后对齐， 哎呀，又没有点上了。从这里就是你要选择全部，然后选了之后他会是这样一个状态，然后给他对齐， 他车他这个对齐了之后，因为我选的这个视力的蛋白，他是同源性很高的，所以他前后可能看起来是这样， 就是很比较整齐的这种，那如果出现的那种前面后面都很不整齐，你就把它剪掉，这个剪掉是没有关系的，你要是保留的话，反而可能会影响他的那个美观啊什么的。我们这个对比作图主要是 就是把它相似的地方比在一块嘛，那假如说这一部分它特别的乱，那你就可以直接把它剪掉，剪掉之后你把这个保存下来， 输出成，注意这里输出成一个这个 fast 格式，不要输出成它那个 make up 自带的， 然后也把这个保存到一个你能找得到的地方，注意这里就是方便自己找得到。那这两个是我刚刚就是通过在录视频之前自己试验的保存的，所以我现在就不保存了，你们到时候把这个保存下来就可以了， 然后这个就可以关掉了，这里就是方便修剪的， 然后找到之后用这个文件，用刚刚那个修剪好的文件也可以，就是直接上传到这里， 那现在我我就在那个上传，就关于他怎么做图已经 那是比较容易的，那我们现在就顺便把这个二级结构如何加上去。再说一下关于这个呢，这个信息就是那个 p d p d b 格式的文件，你要在哪里找？就是去这个 swiss model 这个网站上，它是预测蛋白质三级结构的一个网站，这个网站上操作也很方便，你点进去之后按照它的提示，然后把你的蛋白序列， 嗯，蛋白序的输入输入进去就行了，但是目前我还没有找到他如何就是把很多条那一起预测的这个方法，那也有可能可以是我没找到，也有可能就是他不不可以那样，然后你就 是输一条的进去之后，让他点预测他会出现这样一个， 因为我今天不在这里细说了，因为我准备后面出一个视频，把关于他蛋白质结构的理化性质啊，还有二三级结构预测这种，他都就是放在同一块去讲一下。 然后我们如何得到这个 pdb 的那个文件呢？在这里点这个它的结构的结构分析， 点开之后下面的其他的部分都先不用管，然后我们在这里可以下载他的这个 pdb 的这个文件 就下载了，我之前也下载过，所以直接可以用好，这已经下载好了，你到时候可以点另存为，把它保存到一个方便你找到的地方，然后再 去这个网站，然后从这里选择文件，我们就选随便拿拿个举个例子， 然后这个 p d b 就选你刚刚保存的那个 p d b 的文件，然后底下这些什么都一调整一下参数，给自己给设置一下。哦，对，刚刚忘了说，这里可以，你给他写他名字，那我就是 他输一个题目，假如说这题目，然后你就可以提交 弹出的这个界面， 刚刚没有设置他每一行有多少个氨基酸，到时候可以自己设置一下。那这里就是他的二级结构的分析，这里是阿尔法螺旋，这就是把他他们两个结合在一起了，可以 也可以把这个图保存下来。那其实，呃，我个人觉得这个序列比对的这个内容可以放在一块，那关于它二级结构呢？可以和三级结构这些 一会都放到另一块内容里面。所以你如果要做那个序列比对作图的话，你只需要做一个， 做一个这样的图就可以放到论文里了。然后他也有一些其他的颜色，还有什么设置之类的，你可以尽量调整成你喜欢的样式啊，我最近 正在尝试那个顺势原件分析，他那个做文件特别慢，所以，哎，再摸鱼一下，今天视频就到这里了，下期再见。 如果有什么这些都是我知道的，如果有什么其他更简便的方法或者好用的工具，也欢迎大家在评论区里面讨论和补充。

大家好，欢迎收看由四房居士给大家带来的金道阁实名教程。 上一期呢，我们介绍了这个软件的一些基本情况以及如何安装，那么这一期呢，我们介绍一下这个软件的界面，以及他如何新建或者打开一个项目。首先呢我们双击来打开这个软件 啊，这个软件呢就和常规的这个 windows 软件的界面分布是大同小异的啊，最上面这一栏就是他的标题栏默认显示的金一啊，然后下面这一栏 是他的菜单栏，也就是说关于金大哥所有的命令和操作都可以在这一栏里进行 实现。那么第三行呢，是他的一个工具栏，然后第四行可以理解为是一个常用工具栏啊，就是他把里面菜单栏里有一些常用的命令单独的放到这里来了， 那么最下面的最大的这一部分就是他的操作界面，或者叫做显示界面，最下面这一来 是他的状态来就是显示了每一个命令的状态以及这个操作的一个状态 啊。我们上一集看了这个 help 里面的一些东西啊，其中我说过，就是因为这个软件吗？他现在已经不更新了，然后也稍微有点古老了，就是软件内部的所有关于帮助或者叫说明的这个链接啊，操作呀，这个按钮都是不可用的，他就跳转 过去吗？所以就是你即便这里提示你想要获取帮助， ife 的话，他也没有帮助可以给你啊，这一点大家注意下就行。 好，那么下面咱们介绍呢，还是按照这个菜单栏里的命令啊，就这样依次介绍下去，这次呢就主要介绍一下这个文件里面的操作，这个和大部分软件的这个文件命令都是一样的啊，他在利用这个 曲线把它划分了几个部分啊，就比如第一部分就是这个新建打开与保存这一类的，然后第二部分就是导入导出，第三部分是打硬相关的，然后下面是你最近打开的文件的列表，最后一个是退出， 那咱们就依次来过一下啊，新建，你点击下新建，哎，好像发现了没有什么变化，是吧？但是有些人可能 发现了，就是这个标签栏里刚才由基因一变成基因二了，在基因到个，你新建的这个文件呢，是基因到个的一个，你可以把理解为成一个项目文件啊，他是默认是以这个基因一二三四这样命名的，那么这个文件在你没有导入数据的时候，他显示出来就是一个空白的啊， 所以下面我们就需要来打开或者导入一些数据，当然我们也可以直接打开一个他的项目文件，比如我们选择这个打开之后呢， 在金刚的软件安装完之后，在他的安装入境里啊，就是提供给了我们几个这种视力文件啊，如果你第一次使用这个软件，然后没有比较好的数据的时候，你可以先用这几个视力文件来练习一下， 在他的安装路径里可以找一下啊， 好比如说这个这这个文件里面的这个 m sf 格式的文件，你都可以尝试打开啊， 我们就打开这个 l 第一次 and 这个金刚的这个软件唯一默认的这个格式就是 msf 这格式啊，就是你只可以打开这种格式的就直接打开，那么其他所有的格式都需要利用导入的形式来我们后面给大家演示啊， 我们直接点击打开啊，这个序列格式是不是就很熟悉啊？就是在好多其他这种软件，比如说像 买噶呀，克拉斯特，包括之前讲过的 smoj 啊，里面都会生成这种多序列笔字的格式啊。 大娃娃 那些软件里生成的这个多序的比例的文件呢，不一定是最好看的，或者说他不一定能充分表达你想要表达的这个内容啊，所以说我们就需要利用第三方的软件或者工具来对这个结果来进行进一步的优化或者细化，这个时候你就可以用到 那么第三个，当然你点击关闭的话，就是当前打开的这个项目就可以关闭了，然后还可以保存，比如说我们再打开刚才那个啊， 假如你对这个文件进行一个编辑或修改的话，这个时候你就可以点击保存， 那么他就会在这个原始路径上进行覆盖性的保存，当然你也可以点击另存为，把它另存在另一个地方，但是另 出门的时候，这就会跳出一个赌把框啊，上面这里呢可以输入一些对这个文件的描述性的东西啊，你随便输。 然后下面呢就可以输入这个文件是用什么比对程序进行比对的，以及他的打分举证是什么， 他这个 open 干部和 x 散的干部的标准是什么，你都可以输进去啊，就是这个输的是对这个文件的描述性的东西，他对这个文件或者这个你比对这个结果本身是不产生影响的，当然你不输也是可以的，这个无所谓， 然后点击 ok 之后呢，他会提示您让你选择一个位置保存一下就行了啊，这样就另存位了，那么这里可以看到他储存的这个项目格式呢，就只有 ms f 这个格式啊。 好，那么下面第二部分呢，就是这个倒肉和倒醋啊 啊，我之前说了吗，我们这个用其他软件比对的这个结果啊，都可以放到金道口里去编辑，但是金道口呢，直接打开的就只有他自己的这个 ms f 格式，那么其他的那些多需要的比对格式呢，你就需要用到这个导入来进行数据的引入。 那么在这个动画框里，大家可以看到他这里选择有两种方式，第一种是导入文件，或者是导入你剪切板里的一个东西啊， 然后下面针对数据格式呢，有这几种啊，比如说是发斯塔的，还有克拉斯塔的，还有发力夫的等等等等。那当你选择了一个相应的格式以及相应的文件类型之后呢， 当你点击导入这个按钮之后呢，他就会让你选择需要导入的文件啊啊，我们之前做史莱姆进的时候有一个多序列笔制的，我们找一下 啊，这个当时是这个格式是 smg 的格式啊，他这个格式好像在这里面是没有的，是吧？我们需要重新给他转化一下啊， 这个序列是当时在讲 stm 近多序列比赛的时候给大家演示的啊， 当事业介绍了，在咱们这里也可以对这个比对结果进行一个简单的啊美化与设置在右上角的这些操作里啊，大家有兴趣的可以回头看一下，那么我们需要把它另存为 一个金稻可以导入的格式啊， 比如下面这些格式啊，其实大部分这个经道的都是可以 识别的啊，其中就有他自己的这个 msif 格式，那么我们为了就是显演示一下，就是导怎么导入其他的文件，我们保存成一个这个多序的比例，最常见的格式叫发力不的这个格式啊，保存一下 好，这软件我们关掉， 这时候我们就会看到有这个发力不格式的，直接点击选中他，然后打开 啊，我们需要把这个格式改成这个法拉利格式啊，然后点击导入， 打开之后呢，这个直导入了，然后需要点击一个这个完成的操作啊，他才会正式把这个序列导入。 大家发现啊，因为我们刚才打开的这个项目啊，就是这个 a， l， d， s， n， m， s， f 这个项目文件，所以呢它导入的这个序列啊，就是在我们原始的这个序列下面啊，刚才我们看到了就这个赛空词一到五就导入了这五条序列，把它和这个原始的项目导在一起去了。 所以说我们在操作我们自己的这个数据文件的时候啊，你一般的情况下啊，我们先把这个关掉， 点击否，你一般呢是先新建新建一个，这样的话我们就新建一个空白的一个文项目文件，是吧？这里没有数据，然后我们再向这个空白的里面去导入， 点击完成好，这个时候就是我们想要的这个显示界面了，就是一般情况下，如果你不是想把一些序列导入到另外一个比例序列里面去的话，就是每一个项目都是单独的，这样的话是比较清楚的啊， 好，这就是导入，那么导出也是一样的啊，你可以把我们现在打开的这个项目导出成其他格式，包括呢？比如说现在我这里有五个序列码， 在右侧这个选择这里啊，他默认是选择所有的序列，当你可以从这个列表里进行选择，当你选中这个的时候，你就可以对这五个序列进行单独，或者是按住 sf 的键进行多选， 或者 ctrl 键就是单独的多选，这都是可以的。比如你只想导出这些序列里面的两个或三个，你可以选中前三个，然后 进行导出。下面导出的形式有两种啊，就是导出到一个文件，还要导出到你的剪线板里，都是可以选的， 然后把这个文件导出的格式，巴斯啊，还是等等直接格式，比如把它导出成一个可拉斯的格式，选择导出这个时候会人选个位置吗？我们这个位置就放在这里，然后名字默认就到基因二， 当然这个名字你可以改啊，我们就保持默认吧，然后点击保存，点击完成 啊，这个时候我们再看一下刚才那个文件夹里啊，他就多了一个金二的这个 ln 格式的啊，当然这个格式的我们可以同样的， 我们先把这个关了啊，然后在我们这个金一这个项目里啊，用刚才这个导入，我们再朝上试一下啊，克拉斯到的导入选择金二，打开然后完成， 是不是他就可以导入了啊？大家熟悉这种打开或芯片的方式之后呢，你后面就操作就很流畅了， 那么下面这几项是关于打印的啊，这里使用打印的一般情况下就如果你只是做一个参考或者是临时看一下呢，你可能会打印成纸纸板啊，但通常情况下，我们这里打印是只把它打印成这种 pdf 格式，因为这个 软件的就是唯一一点不太好的，就是他不能直接在文件里把它另存或者导出成图片格式， 当然这也不能说是这个软件不好的地方了，那么后面我们会介绍他相对应的这个优势在哪里啊？但是呢，如果你想要一个高质量的图片，或者是分辨率比较高的这个图片的话，你怎么办呢？我建议大家可以把只用打印方式 打印成 pdf， 那么你在 pdf 里就可以把它输出成高质量的图片了啊， 第一下就这个打印啊，这个打印就直接打印了，那么我们通常情况下你打印之前可能要预览一下是吧？点击这个打印预览就可以预览你这个序列的格式，那么他这个打印呢，就只是把我们刚才显示的这个序列啊，把它打印在这个 a 四纸上， 那么至于他打印出来的这个效果啊，一般情况下来说了吗，不一定是你想要的那个效果，就是如果你直接把这个打印出来这个效果 啊，想放在你的文章里去的话，直接用这个功能好像似乎还是不太好的。那么后期我会给大家介绍怎么把这个嗯序列文件导出成你想要的这种最终的显示的格式啊，这个是我们 后面要给大家讲的。好，那下面这里就是列出了你最近打开的这几个项目的列表啊，你可以通过这里来快速的再次把它打开，那么最后这个退出呢？点击完之后就是退出这个软件啊，就没有了。 好，那么这期视频呢，我们就给大家介绍一下这个基因道口软件的界面的积木情况，以及他如何新建和打开一些他的项目。那么 后面视频呢，我们会接着啊，依次按照这个菜单栏的命令来给大家来详细介绍里面每一步的这个参数设置，以及他这个具体效果是什么样的。 那么我刚才讲的这个文件菜单里面的这几个命令呢，对应的就是咱下面的这前六个这个工具按钮，那么其中 后面这两个帮助相关的这个按钮是就是没有什么用的啊。好，谢谢大家继续关注私房居室的金段款软件视频教程啊，那么其他系列的视频呢，我们后期也会有陆续更新，希望大家继续关注，谢谢大家的支持。

大家好，欢迎继续收看由四方居士给大家带来的基因档口视频教程。那么今天我们接着上一期视频，继续给大家介绍和这个的项目里面和飞格里面的一些相关的设置。首先我们还是打开这个软件，打开一个项目， 选择 project 里面的 configure， 上一期视频我们介绍了 project print， 还有啊就这两项啊，因为第一项这个基础产生设置这个比较多，我们花的时间也比较多啊，那么今天我们就接着讲第三个， 这个叫睡的，睡的就是他下面这个底纹啊，就是这个显示的这个背景色，或者叫高亮的这个色块， 这个也是比较基本的一个设置啊啊，首先我们看啊，他最左侧有一列关于这个底纹，我们去看底纹吧，底纹模式的依据是什么？比如第一个是保守性，还有这个是量化的，还有依据这个氨基酸的属性， 以及你的检索模式结构理化性质，还有这个一致性，以及这个对数几率等等等，这几个啊，就是我们在这个经道口里面做多序的比对，显示的常用的这几种模式。 那么根据你想表现的这个目的不同啊，你可以选择不同的模式，他每一种模式都有几种显示的级别啊，比如说不显示两级、三级、四级，就是他这个四级就显示的越来越详细嘛，比如我们给大家看 看一下啊，我们就以韩文这个倒车型来说，如果我们点击不显示的话，他就只有这个序列，后面就没有任何的标注， 那如果我们选两集，他就在这个保守性的基础上把它细化分为两集啊，看到没有，他就是基本上就只有一致的和不一致的，我叫保守的和不保守的， 当我们把它分成三级的时候啊，你看到他就又多了个灰色的吧，就是相当于是稍微有点不保守的，就这样的，那最多可以分到四级， 他这个分级啊，是依据这个保守性的百分比啊，比如说百分之一百，百分之八十，百分之六十，当然这个直径是可以改的啊。然后后面还有就是安全残疾的显示模式，一般是正常的还是 是差异的，通常情况下我们显示的是保守的或者叫一致的这个标注成地纹，然后这个有差异的地方呢，他就是没有颜色的，那如果你选择这个不同的呢，他就会把这个不同的这个氨基酸显示出来，然后相同的这个就用点给代替了， 这样就是你看差异的话就很明显，是吧？ 那么当然下面还有这个底纹的这个样式啊，是这种保守的还是这种阶梯形状的，还是这种三阶形的，比如我们把这个还改成正常的啊，四 g 看后面这个是阶梯形状的，大家可以看到差异吗？ 就是他这局模式，他显示的是不太一样的啊， 根据自己的需求可以去设置。 当然还有下面是这个 差异显示的这种风格啊，是不同的和薄寿的差异呢？还是说不同的和顶部的最上面这个区别的差异啊，这个也是可以选择的。 然后最下面是四个颜色设置的啊，因为我们上面这个四个来往就是四个等级呢，对应了四个不同颜色，比如在我们现在显示的这个里面，他对应的就是这个黑色、灰色 或者叫浅灰色，还有一个白色，白色就相当于是没有加颜色吗？当然这个颜色你可以自己改啊，比如我们可以把这个前景色改成红色，就是字的颜色，然后背景色改成改成黄色等等，这样的啊，这样你确定之后他就 会把它改成相应的颜色，彩色有时候可能看起来更好看一点，是吧？ 好，这个就是关于这个底纹的这些设置啊，就是主要是从视觉上去给大家一个效果。那么下面第四个标签呢？是关于报告，因为在后面我们将要讲这个报告选项啊，这是对这个报告的一个基本的设置， 主要也就是这么几项啊，不是很多，他这里就是主要设置这个报告显示的什么东西及怎么显示啊？ 比如说显示哪些计算结果，以及这个结果是显示这个绝对值呢？还是百分比，以及他输出是输出一个矩阵或者输出这种行列式啊，不叫行列式，就是一行一行的这种门门，然后下面还有这 标签的位置呀，以及这个标签的风格呀等等这些参数。一般情况下我们用这个金档啊，去做这个多序的比对的时候， 基本上不会用到这个报告的结果啊，一般的就是你是做这种就是生活心理学啊，或做方法之类的，你可能会需要这个报告的数据或者什么的去拿去用啊，这个我们到后面讲报告的时候再说。 那么还有第三个就是这个，嗯，从这个标间开始啊，如果你注意看到的话，他后面这几个都对应的是刚才我们第一文这里的第一个这个模式啊， 比如说这个 property 属性，就从这里开始，第三个、第四个、第五个 strokes， 第六个礼花筒在上面还有阿 nantety， 还有这个对数几率反应，或者叫对数几率啊，是这个，然后最后有个额外的打分局，这几个 对应的这几个，因为我们前面这个两个保守性和这个量化呢，他这个颜色呢，我们都可以在这里设置，是吧？ 包括这个分级的这个标准都是在这里设置的。那么比如当我选择这个属性的时候呢，我这个属性的是在哪里呢？他就单独把它拿出一个标签出来，我们就在这里设置属性， 这个属性呢有三个分级啊，那每一个分级所代表的这个具体的含义在左边这个列表框里我们可以看到啊， 这里的一二三这三个分级呢，是进到个软件里面他默认的这个分级啊。当然你每一个分级他这里依依据是什么？就比如说是这个氨基酸的急性和非急性啦，带电不带电啦，或者说是他带有什么样类型的残疾啦 等等这些啊。当然这个不是固定的，他这里提供了这一个之外呢，可以编辑他啊， 我们看这个最多的，就当我们选了之后，你会发现他这个前面这个需要这里会标黑，是吧？说明这个条目是可以被你修改的，当你选了他之后，可以点击这个编辑他现在，嗯默认的这个条目二也是只有 hkr 这三个，你说你可以给他加一个或者给他删一个，都都是可以的啊， 都是可以的。也就是说这个分级标准其实可以根据你的具体的实验内容以及这个研究目的呢进行自定义啊。当然同样的这个显示的颜色啊，文本的颜色，比如说选择黑色 或者这个背景颜色也可以给大家进行更改啊，更改完了之后，当你点确定之后， 选择这个 property 的时候，就以属性来显示的时候，这个界面就进行更新了啊， 好，今天我们就把这个项目基本设置里面的这三个标签里的内容给大家介绍一下啊啊，剩下内容咱们后面继续给大家讲，希望大家继续关注四方居室的视频更新，好，谢谢大家。

上一期呢，我们介绍了 windows 系统，这一期我们来讲讲苹果系统有哪些优势呢？我们先来看看苹果最新推出的麦克 pro， 采用的是 ips 技术的 led 背光显示屏， 是 p 三广色域与原材显示技术。搭载的呢，是苹果自研的全新无纳米 m 一芯片八到十六 g blpddsx uma 统一内存二五六到五幺二 gbssd 卡。而它的售价呢，却高达一万三千三百八十九元。 反观同级别的其他品牌笔记本，售价是远低于苹果的。在操作方面的， mac 操作起来就比 windows 的逻辑更加的简单， 视觉感受更流畅，是一款没有学习难度的操作系统，应用性较强。比如说呢，删除一个软件。在 windows 上呢，需要打开控制面板，然后点击卸载完全系统。那么对于新手来说， 理解删除和卸载是一件非常困难的事情。而在 mac 上呢，就非常的方便了。删除一个应用呢，就是到应用程序目录下，把要删除的程序直接而丢到垃圾篓就 ok 了， 保持与删除行为的语言一致。苹果电脑的定位呢，是工具电脑。特性呢，就只适合软件开发设计、后期办公等，是一个生产力定位的电脑。但是呢，他不适合打游戏，他的系统硬件以及软件都没有针对游戏进行一个设计。 比如苹果电脑的屏幕主要是色彩还原和分辨率，并不是刷新率，显卡呢，也是专业卡。所以啊，如果你要打游戏的话，建议呢还是安装一个 windows 系统会比较好。 再有呢，苹果有 lf 传输文件、记事本同步等功能，办公起来真的非常的方便了。我是五哥，关注我，下期给你看看苹果电脑和 windows 的对比。