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「单细胞全长转录组」最新文章(三)新冠免疫应答的“剪接密码” 本期视频,我们一起来看一篇2025年9月由柏林夏里特医学院研究团队发布在预印本系统bioRxiv上的研究论文。 该研究利用单细胞全长转录组测序技术,对9名COVID-19患者和3名健康对照的鼻咽拭子样本进行了单细胞全长转录组测序,结合已有的二代单细胞数据,系统分析了不同细胞类型中转录本异构体使用差异及其在免疫调控中的功能意义。 研究在31,546个细胞中鉴定出主要的上呼吸道细胞类型,包括多种上皮细胞和免疫细胞。转录本分析显示,大多数基因仅表达一个主要异构体,且绝大多数为蛋白质编码类型。 通过对比长读长和短读长单细胞RNA测序数据,发现两者在细胞类型鉴定上具有高度一致性。 通过差异基因表达和差异转录本使用分析发现,在COVID-19患者与健康对照的比较中,纤毛细胞和分泌细胞展现出最显著的基因表达改变。 通过GSEA分析发现部分基因在总体表达上无显著变化,但其异构体使用比例发生显著改变,进而可能影响蛋白功能。 在COVID-19与健康对照的关键免疫通路中,研究发现抗凋亡基因FAIM在纤毛细胞中从长异构体转向短异构体,核糖体基因RPS3A在T细胞中也发生异构体转换,这些转录本层面的精细调控共同塑造了宿主对病毒的特异性免疫应答。 在中度与重度COVID-19患者的对比中,研究发现了关键免疫通路存在特异性异构体转换。T细胞中,酪氨酸激酶FYN的全长功能异构体FYN-202在重症患者中上调,可能增强T细胞受体信号传导,而与免疫过度激活相关。 好啦,以上就是今天分享的内容啦,咋们下期再见!
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