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MS软件-过渡态搜索 过渡态搜索 设置计算参数:打开DMol3计算对话框,将任务(Task)更改为“TS Search”。在“More”选项中,选择完整的LST/QST搜索协议(Complete LST/QST)。同时,根据需要设置其他计算参数,如质量、函数等。 计算频率:在属性(Properties)选项卡中,勾选“Frequency”选项,以便计算过渡态的频率。 运行计算:设置完计算参数后,点击“Run”按钮开始计算。在计算过程中,LST/QST图将显示在工作区,监测过渡态搜索的进程。 四、查看与分析结果 查看计算结果:计算完成后,在.outmol文件中查看计算结果。可以使用“CTRL+F”快捷键搜索“Energy of barrier”来找到能垒信息。同时,也可以查看过渡态的能量和其他相关信息。 查看虚频:在过渡态中,通常会存在虚频。双击.xsd文件,选择“Tools”工具栏中的“Vibrational Analysis”选项,然后点击“Calculate”按钮计算虚频。虚频对应的反应模式可以用动画展现出来,这有助于理解过渡态的结构和反应过程。 过渡态优化(如有必要):如果搜索到的过渡态结构不够优化或存在多个虚频,可以进行过渡态优化。双击.xsd文件,打开DMol3计算对话框,将任务更改为“TS Optimization”,然后运行计算进行优化。 五、确认过渡态 TS Confirmation:为了确认搜索到的过渡态是否准确,可以使用TS Confirmation功能进行进一步的验证。双击.xtd文件,打开DMol3计算对话框,选择“calculation”并点击“TS Confirmation”选项。如果得到中间点能量低于反应物或生成物,说明设置的过渡态可能不准确,应当用这两个能量最低的点的结构再做一次confirmation。 虚频确认:在优化后的过渡态结构中,应该只有一个虚频。如果虚频数量不符合要求,可能需要重新进行过渡态搜索或优化。#制图基础入门教学 #search函数 #艺术在抖音
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