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算筹科技1年前
分子动力学模拟GROMACS常用的分析数据作图与轨迹查看 本课将介绍分子动力学模拟GROMACS常用的分析数据作图与轨迹查看，使用origin软件对分子动力学模拟分析RMSD、RMSF、SASA、Rg、hbond 数量等数据进行作图。 欢迎大家在评论区留言指正，多多交流，有任何问题都可以联系小编哦~ #分子对接 #分子动力学 #分子动力学模拟 #rmsd #rmsf @DOU+小助手
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Time-Action1年前
分子对接太Low？那就来个分子动力学！ 需要帮忙代做或教学的uu可以戳戳UP主！ #分子对接 #分子动力学模拟 #科研 #SCI #Gromacs
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元素魔方科研服务8月前
分子动力学模拟原理与应用案例 #MD模拟 #理论计算 #药物开发 #生物 #科研
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算筹-md模拟王老师6月前
分子动力学模拟GROMACS常用的分析数据作图与轨迹查看 本课将介绍分子动力学模拟GROMACS常用的分析数据作图与轨迹查看。使用origin软件对分子动力学模拟分析RMSD、RMSF、SASA、Rg、hbond 数量等数据进行作图。 #分子对接 #分子动力学 #分子动力学模拟 #gromacs #origin @算筹科技
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生信人9月前
带你了解分子动力学模拟 #生信分析 #分子动力学 ##高效学习
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互动派教育2年前
#LAMMPS #分子动力学模拟 #教学视频:#化学分子 #三维结构 #数据可视化 #软件教学 --#VMD @互动派教育 为您提供更优质的#教育资源 ：#水分子 #盐溶液 三维分子建模，#SCI论文 必备#科研工具 #学霸秘籍分享
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小马丁8月前
使用deepseek动动嘴就能完成分子动力学模拟任务全过程！ #干货分享 #deepseek #分子动力学模拟 #分子动力学计算 #mcp 一个很有意思的mcp应用，作者使用了 gpt4o,deepseek等大语言模型操控本地的 gromacs和vmd,进行了一次完整的蛋白质分子动力学模拟任务，全程都是通过聊天完成，支持全自动/交互式的半自动的模拟，分析和可视化。
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陶术生物1年前
分子动力学模拟结果如何查看？附distance、rmsd分析 分子动力学模拟结果如何查看？分子动力学模拟凭借其动态的研究方法和丰富的分析手段等特点，可用于分子结构和构象研究、分子互作研究和动力学行为研究等。本期陶术小课堂将为大家演示分子动力学模拟结果查看及distance、rmsd分析，包教包会哦，点击视频一起学习吧✍️陶术生物可提供分子动力学模拟的技术服务：优势在于：1、有强大的计算资源，可以计算ms级别的时长；2、多年的经验积累，能够精准的算出体系的性质，并合理性分析；3、可提供全面的报告及后续解读。欢迎咨询 #CADD #计算化学 #陶术生物 #科研狗日常 #分子模拟 #分子动力学模拟
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算筹科技1年前
含碳纳米管聚合物的拉伸模拟 利用软件MS建立聚合物单体并优化分子结构，之后构建含有碳纳米管的聚合物模型并进行能量弛豫，最后进行拉伸分子动力学模拟，输出得到应力应变曲线以及拉伸过程中的若干快照图，可用于碳纳米管聚合物在拉伸过程中的微观机理研究。 #分子动力学 #分子动力学模拟 #MD模拟 #MS #材料动力学 @DOU+小助手
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算筹-md模拟王老师5月前
gromacs常用的分析数据作图与轨迹查看-说明 本节课将讲解分子动力学模拟gromacs常用的分析数据作图与轨迹查看-说明上期，解释一下分子动力学模拟分析RMSD、RMSF、SASA、Rg、hbond数量等数据做出来怎么用在文章里 #分子动力学 #分子动力学模拟 #分子对接 #rmsd #rmsf
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模拟代算（tjskyfw123）1年前
分子动力学模拟案例 👉Al/Al2O3复合材料Reaxff反应力场分子动力学模拟，两侧红色原子为氧原子，中间红色原子为铝原子，黄色和蓝色原子为氧化铝#分子动力学模拟 #科研服务 #模拟计算 #上热门🔥
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算筹-md模拟王老师6月前
对接后的分子动力学模拟-力场选择与结构处理 本课将介绍对接后的分子动力学模拟力场选择与结构处理。 #分子动力学 #分子动力学模拟 #分子对接 #蛋白质结构 #生信分析 @算筹科技
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算筹科技1年前
分子对接 分子动力学 分子动力学模拟 分子模拟 md模拟 MD分子动力学模拟、分子对接、亲和力稳定性分析、自\共组装模拟、膜体系、电解液溶剂化分析，模拟计算、找算筹科技#分子对接 #分子动力学 #分子动力学模拟 #分子模拟 #md模拟
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算筹科技1年前
沥青自愈合分子动力学模拟 利用Materials Studio软件对沥青愈合进行分子动力学模拟，研究不同温度和裂缝尺寸对沥青自愈合的影响。 #分子动力学 #分子动力学模拟 #材料动力学 #MS #msd @DOU+小助手
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Ai尚研修5月前
LAMMPS分子动力学模拟实战（三） #热点 #LAMMPS #分子动力学 #分子动力学模拟 #课程分享
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易加服务器工作站5月前
高性价比分子动力学模拟计算服务器！ 硬件配置： CPU AMD霄龙7742 64核心128线程两颗 主板 超微H11DSI-NT 内存 三星32G DDR4 ECC 4条 总容量128G 硬盘 1个三星990PRO 1T M.2 SSD 1个希捷4T 企业级机械盘 显卡 华硕RTX3060 12G显存 塔式5导管散热器两个 5把系统调速风扇 巨龙金牌1250W模组电源 黑色塔式服务器机箱 #分子动力学计算 #科学计算服务器 #流体力学计算仿真服务器
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算筹科技1年前
分子动力学 分子对接 MD模拟 分子动力学，通过模拟和计算分子的运动轨迹和相互作用来揭示物质的多种宏观性质。算筹提供从分子对接到蛋白三维模型搭建，再到动力学后数据分析等一系列丰富的计算内容。 #分子动力学 #分子动力学模拟 #gromacs #lammps #算筹科技 @DOU+小助手
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易加服务器工作站1年前
用于分子动力学模拟计算的服务器！ 硬件配置 64核心128线程CPU，256G内存，INTEL 7.68T U2企业级SSD 塔式静音服务器 #分子动力学模拟 #有限元分析计算 #科学计算服务器 #diy电脑 #服务器 @DOU+小助手
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加衣那6月前
创新教学#教师制作实验教具 #做一名有智慧的教师
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草稿废纸生产者1年前
小分子和小分子的动力学模拟 #分子动力学模拟#分子对接模拟计算 #分子对接#autodockvina #小分子和小分子的动力学模拟 实现windows下的gromacs，小白也可立马学会的动力学模拟。
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Ai尚研修9月前
LAMMPS模拟精要：方法、条件与经验分享(一） 1、分子模拟概述及分子动力学模拟的重要性 2、分子动力学模拟的基本原理 3、做好模拟所需条件及基础 4、应用范围与应用实例分析经验分享 #每天学习一点点 #知识点总结 #分子模拟 #分子动力学 #人工智能
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win妹1年前
Lammps2024-11最新版本作为分子动力学模拟 资源获取 v搜索：win妹 回复关键词 Lammps 即可获取资源 点个赞，点个关注 #Lammps #分子动力学模拟 #软件分享 #资源获取
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win妹6月前
送命令生成器一键安装Gromacs 资源获取 v搜索：win妹 回复关键词 Gromacs 即可获取资源 点个赞，点个关注 #Gromacs #生物分子 #分子动力学 #分子建模软件
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贰零壹组装服务器9月前
分子动力学模拟计算服务器 X13DAI-T/8575C/三星64G D5/RTX4080S/致态1T M.2 SSD/巨龙 2000瓦/塔式服务器机箱 #分子动力学模拟 #RTX4080S #致态固态硬盘 #组装服务器配置方案
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瓜皮群主4月前
VASP计算服务器！双路EPYC7R32 96核心192线程 #vasp #vasp计算 #dft #分子动力学模拟 #流体仿真 上周帮一位南京的老师装的vasp服务器，最近好多64核心的u是便宜，但是橙色大部分惨不忍睹，看需选择吧。一群697628033，二群839576980，三群941533480，四群576813749，五群专业群140478295。不是商家，进群交流硬件，伸手党勿入，免费写配置装机。本期配置如下： EPYC 7R32*2 技嘉mz72 sk 3200 16g*16 海力士p44pro 2t 利民1200w 利民tr4 ta120ex*2 追风者620pc
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稳妥少年·药智未来🌈1周前
稳妥少年——分子动力学模拟结果xvg文件可视化分析平台 XVG格式是分子动力学模拟（特别是GROMACS工具包）中广泛使用的文本数据文件，其扩展名通常为.xvg。该文件以纯文本形式存储，结构清晰：文件头部以“#”或“@”开头的行包含注释和图表元数据（如标题、坐标轴标签），后续则是规整的列式数据，第一列通常为模拟时间，后续各列则对应不同的物理量（如能量、温度、距离等）。
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学术渣在欧洲1周前
198. 一键分子对接 内置 GROMACS 和 OpenBabel分子动力学模块优化
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科研小猪莹3周前
分子模拟RMSD解析 #分子模拟 #RMSD #医学生 #科研 #读博
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生信分析手册2月前
分子动力学模拟，让你的靶点研究 “动” 起来。#分子动力学 #分子对接 #药物筛选 #计算生物学 #文章进阶
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科研小猪莹2周前
RMSD模拟指标绘制 #分子模拟 #医学生 #MD #
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稳妥少年·药智未来🌈4天前
从蛋白质-蛋白质对接到分子动力学模拟（全流程教学） 蛋白质-蛋白质对接是一种**计算预测方法**，旨在模拟两个或多个蛋白质分子如何通过空间和化学相互作用，形成稳定的复合物结构。其核心在于从数百万种可能的空间取向和构象中，筛选出能量最稳定、最符合物理化学规律的结合模式。它主要提供相互作用的**静态“快照”**，回答了“蛋白质能否结合以及如何结合”的问题，是研究信号传导、免疫识别、酶调控等分子间相互作用的重要起点。 分子动力学模拟则着眼于**动态过程**。它基于牛顿力学原理，通过数值计算模拟原子在特定物理条件下的运动轨迹。该技术能够揭示蛋白质结合前后的构象变化、结合路径的动态细节、以及复合物在溶液环境中的稳定性与灵活性。它将静态的结构“照片”扩展为动态的“电影”，使我们得以观察诸如蛋白质折叠、底物催化、别构调节等关键生命过程的微观细节。#学习 #编程 #动力学模拟 #蛋白质对接 #分子对接
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科研小猪莹1周前
自由能形貌图解析 #科研 #自由能形貌图 #分子模拟 #医学生 #读博
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计算学术2周前
围观正癸烷燃烧的分子现场！ReaxFF模拟终极解密产物演化#湖南航检 #分子动力学模拟 #湖南航检 #理论计算 #第一性原理
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计算学术2周前
铝纳米颗粒建模、弛豫及MSD分析：LAMMPS分子动力学实现#湖南航检 #分子动力学模拟 #湖南航检 #理论计算 #第一性原理
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羽了个点5天前
LammpsMPI版作为分子动力学模拟 v搜索：羽点学姐 回复： 则可获取资源 有用可点个赞谢谢！ #lammps #分子动力学 #软件安装 #分子模拟 #软件安装
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邱新龙-计算菜鸡3月前
分子动力学模拟合理建模的思路 #模拟代算 #计算化学
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硕星计算、实验、服务1月前
#分子动力学模拟 #实验测试 #计算模拟
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科研小猪莹2周前
啥电脑可以跑分子模拟？？？ #分子模拟 #分子动力学模拟 #医学生 #Alphafold
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算筹科技9月前
VMD技巧分享之如何绘制高保真水盒子照片 本课将介绍如何使用VMD绘制高保真水盒子照片。欢迎大家在评论区留言指正，多多交流，有任何问题都可以联系小编哦~ #分子动力学模拟 #分子动力学 #分子对接 #gromacs #VMD @DOU+小助手
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魔德科技2周前
如果药物设计有"外挂"，那一定是分子模拟! #分子模拟 #分子动力学模拟 #分子对接 #同源建模 #量子化学
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科研小猪莹3周前
分子模拟常规参数设置 #分子模拟 #分子对接 #读博 #科研 #医学生
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天玑算·科研服务(官方号)1周前
原来热电的这个参数这么多人都不清楚 #热电 #第一性原理 #DFT #天玑算 #分子动力学模拟
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魔德科技1周前
细菌存活机制卡壳？分子模拟研究搭新框架！ #分子模拟 #分子动力学模拟 #同源建模 #魔德科技
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科研小猪莹1周前
2d 3d FEL自由能形貌图 #自由能形貌图 #医学生 #读博 #分子对接 #科研
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鹏迈组装服务器1周前
GROMACS/分子动力学模拟计算服务器装一台，霄龙二代128核心处理器，1TB运行内存，超微双路服务器主板，硬盘512G+两个希捷8T机械盘，最后装一块3080TI游戏版显卡#GROMACS#分子动力学#科技#DIY
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智智数据分析师6天前
8+网药+代谢组+分子对接+动力学模拟 #gbd数据库 #医生评职称 #数据分析 #nhanes
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九章算4天前
动力学模拟、分子对接、同源建模等均可承接 #分子动力学模拟 #生物 #科研 #分子动力学 #九章算
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生信宝藏1周前
分子动力学模拟 分子动力学模拟代做，结果包括rmsd，rmsf，rg，sasa，hbond，fel2d和3d图。有需要的咨询 #分子动力学模拟代做 #一键分子动力学模拟 #分子动力学模拟画图 #分子对接
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中科科翼计算模拟2周前
2.ChemOffice软件教学-软件介绍（2) ChemDraw#ChemOffice #材料科学 #分子动力学模拟 #药物研发 #中科科翼计算模拟
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中科科翼计算模拟2周前
1.ChemOffice软件教学-软件介绍（1） #ChemOffice #材料科学 #分子动力学模拟 #药物研发#中科科翼计算模拟
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计算学术2周前
核心聚焦铝纳米颗粒的精准建模与结构弛豫技术，系统掌握LAMMPS建模命令在纳米颗粒体系构建与弛豫过程中的应用方法#湖南航检 #分子动力学模拟 #湖南航检 #理论计算 #第一性原理
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中科科翼计算模拟1周前
3.ChemOffice软件教学-软件介绍（3)Chem3D#ChemOffice #材料科学 #分子动力学模拟 #药物研发 #中科科翼计算模拟
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科研小猪莹1月前
搞清分子动力学模拟 #科研 #医学生 #读博 #分子对接 #分子模拟
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魔德科技3周前
抗菌药研发卡壳？如何“算”出高活性抗菌分子 #分子模拟 #分子动力学模拟 #同源建模 #分子对接 #魔德科技
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中科科翼计算模拟1周前
4.ChemOffice软件教学-软件介绍(4) ChemFinder及三者联动#ChemOffice #材料科学 #分子动力学模拟 #药物研发 #中科科翼计算模拟
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云生信课代表丰恒1周前
-多靶点验证+选题精准！福建医科大这篇网络药理学思路有点东西，结合分子对接和动力学模拟2个月接收！#云生信 #生信分析 #医生 #研究生 #科研
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小熊软糖1周前
物理仿真-理想气体的分子速度分布
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铜陵浩辰科技有限公司9月前
腐蚀介质扩散行为的分子动力学模拟 基于Materials Studio对腐蚀介质在缓蚀剂膜中扩散行为的分子动力学模拟 #MS #分子动力学 #扩散 #均方位移 #腐蚀介质 #缓蚀剂 320科技工作室专注于分子模拟|仿真分析|编程开发等科研和工程领域， 持续为客户提供优质计算和教学服务，有需要的小伙伴，欢迎随时联系我们。 公众号：320科技工作室
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计算学术2周前
分子动力学的“暴力测试”：剪切、摩擦与燃烧的微观盛宴#湖南航检 #分子动力学模拟 #湖南航检 #理论计算 #第一性原理
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邱新龙-计算菜鸡2年前
gromacs教程2-初步了解分子动力学流程 #分子模拟
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薛定谔软件2周前
蛋白质柔性的非分子动力学方法
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邱新龙-计算菜鸡1年前
手稿直播课8-分子动力学模拟建模思路 #分子模拟
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