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Poppy读博版
6天前
如何解析CRISPR文库筛选数据❓️视频版🔥 前段时间学习了RNAseq的数据分析,从上游数据到下游数据分析,学的费劲吃力。最近看文献经常看到大文章提到CRISPR文库,利用CRISPR文库进行大规模基因功能筛选等。所以就又学习了一下CRISPR文库数据分析~ ✅CRISPR文库分析流程 ✅iScreenAnlys文库分析 源井生物CRISPR文库服务包括了文库质粒、Cell pool&病毒、体外筛选、体内筛选、NGS测序整个流程,我比较喜欢他们家的iScreenAnlys文库分析,有包括RRA、MLE、DrugZ在内的多种分析方法自己选择,主要是分析+作图可以一键“傻瓜式”操作,比起我前段时间自己敲代码分析数据方便多了。 #研究生日常 #CRISPR #CRISPR文库 #生信 #源井生物
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食分有趣sfyq
1年前
转录?转录组学! 【分子生物学知识点分享】来自『关东组』的学生作品展示|相信大家听说过“转录”,那么什么是转录组学呢?看完这篇你会有一些了解~#分子生物学 #转录组学 #每天学习一点点
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艾基生物
3周前
什么是转录组?它包含mRNA、microRNA等,如何通过qRT-PCR、RNA-Seq技术解析细胞功能? #转录组 #基因表达 #分子生物学 #科研入门 #生物科普
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生信分析手册
1月前
除了差异分析,你的转录组数据还能做这 5 件事#转录组 #数据挖掘 #GSEA #免疫浸润 #ceRNA
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海归张教授讲测序
1周前
张教授来讲讲做全转录组的总流程 1、捕获与转换 2、建库与放大 3、上机与解码 #单细胞测序 #云鸿检验 #测序 #云鸿生命 #知识科普
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组学大讲堂
7月前
转录组测序原始Fasta数据上传NCBI #NCBI #转录组 #测序分析 #生命科学 #研究生
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言小七
4天前
搞定GSEA富集分析,附保姆级代码与图解 #生信分析 #富集分析 #GSEA #研究生 #转录组
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组学大讲堂
6月前
转录组表达量数据上传GEO数据库 #NCBI #转录组 #测序分析 #生命科学 #研究生
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迈维代谢-小维
1年前
转录组+代谢组数据如何玩转WGCNA分析 #转录组 #代谢组学 #多组学 #wgcna #数据分析
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小碗爱科研
4天前
【跟着我看转录组!!】GSEA富集分析(上) #转录组 #富集分析 #生信小白 #学习分享 #科研
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杰哥的生信分析
1年前
单独转录组测序还能发7+SCI?转录组+分子对接+实验验证思路,了解下 #医生 #博士 #科研 #sci #论文发表
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张嘴谈生信
4天前
普通转录组 对从UCSC下载的TCGA数据进行数据处理#sci #医学生 #科研
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生信猫_阿城学长
1周前
除了两两比较和三组比较,2026转录组高阶玩法还有啥 #医学SCI #医学科研 #生信分析 #临床研究 #规培 2026年了,还在用差异表达+富集分析的老两样在对付所有情况?转录组高级玩法看来过:两两比较/三组比较/梯度处理/多组比较,上下两期讲清楚!
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贝纳基因
1年前
转录组关键基因挖掘一--从海量基因到差异基因的筛选 RNA-seq技术通过对所有mRNA进行测序,能够全面捕捉一个样本中的基因表达情况。由于基因数量庞大,通常每个物种测序出来的基因数都达到上万个,因此RNA-seq数据分析的一个核心任务是从中筛选出在处理组与对照组之间显著差异表达的基因。这些关键基因对于揭示处理和对照之间的表型差异至关重要。 为了缩小关键基因的范围,一种常用的方法是根据Fold change(倍数变化)和P-value(统计学显著性)来筛选差异表达基因。通常情况下,通过设置合理的阈值(比如Fold change > 2 和 P-value < 0.05),可筛选出几百到一千五百个左右的差异表达基因,从而有效地缩小了关键基因的范围。#知识科普 #转录组 #基因 #人文星闪耀计划 #科普
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记忆LIU
2周前
单细胞转录组(scRNA-seq)和空间转录组技术如何优势互补,一起使用如何推动我们在精准医学和解读疾病机制以及临床转化研究等方面的新的突破#医学科研 #临床医学
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爱发疯爱科研的小熊
4月前
单细胞vs单细胞核转录组!科研党必存 1.单细胞转录组(scRNA-seq):新鲜样本“显微镜” 抓完整活细胞分析,能测细胞核+细胞质所有mRNA,细胞异质性、稀有细胞类型全捕捉!适合血液、培养细胞等易解离样本,研究胚胎发育、免疫分型超给力~#单细胞转录组 2.单细胞核转录组(snRNA-seq):难搞样本“救星” 只取细胞核就能测!冷冻组织、大脑、肿瘤这些“硬骨头”样本轻松hold住,还能避免细胞解离损伤,珍贵临床样本分析就靠它~#单细胞核转录组 #实验不踩坑 3.怎么选?看这2点! 新鲜样本+要完整基因数据→选单细胞;冷冻/难解离样本+怕细胞损伤→选单细胞核!平台选10x Genomics(高分辨率)或国产(3999元起性价比高)~#科研干货 #转录组选择指南
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科研小白2024
1年前
转录组测序结果分析(案例) #科研工具 #科研绘图 #科研人员 #科研狗
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小陌
1年前
转录组-PCA分析
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小碗爱科研
1周前
【转录组呀!!】KEGG富集分析保姆级分享 #转录组 #富集分析 #KEGG #科研 #生信分析
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师兄说科研
6月前
三代测序100问(7):如何用三代测序技术解析全长转录本? #三代测序 #全长转录组 #生信分析 #科研 #经验分享
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贝纳基因
1年前
一分钟转录组结果解读——PCA篇 #转录组#基因 #创作灵感上热门 #科普 #PCA
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如意如意科研意
10月前
一次性拿下单细胞转录组 scRNA-seq 全流程 完整的分析流程代码,全中文详细注释,已排除bug,直接复制粘贴即可运行!全部分享 #医学科研#医学博士#医学sci#生信分析#单细胞测序 #单细胞测序
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致恒星辰生物
5天前
谁能拒绝转录组测序质量结果图详解(上) #生信分析 #今日份学习动力 #转录组图
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🌸芽艺❤️
10月前
多组学测序服务#代谢组#转录组#蛋白组#宏基因组 包了半年饺子,就为了今天这点醋
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杰森生物
1年前
转录组测序(RNA-Seq)数据分析中的差异表达基因筛选 转录组测序(RNA-Seq)数据分析中的差异表达基因筛选 #生信分析 #SCI #科研日常
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半斤静静
8月前
二代测序|单细胞转录组快速入门 转录组发展了很多年,近几年兴起的单细胞转录组也逐渐成为大家的科研选择。那单细胞转录组和转录组有什么区别呢?是不是所有的样本类型都可以做单细胞转录组,单细胞是如何分离的?技术流程是什么? 本期视频将和大家分享单细胞转录组基本内容,希望对大家的理解有所帮助。 感谢大家的支持!我会继续努力更新的~ 祝大家科研顺利,生活开心#知识科普 #单细胞测序 #单细胞转录组 #转录组 #科研
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元莘生物
1年前
转录组多组学的应用和研究思路 有影响因子居高的文章分享哦~
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川肿放疗王奇峰
4天前
看清肿瘤的“帮凶”—成纤维细胞(CAF)的空间秘密! 通过空间转录组学和蛋白质组学技术,在多种癌症类型中系统地绘制了癌相关成纤维细胞(CAF)的空间图谱。研究人员识别出四种具有独特分子特征和空间分布的CAF亚型(s1–s4),它们分别占据肿瘤边界、基质生态位、骨髓富集区及淋巴结构。分析显示,这些亚型通过复杂的细胞间通讯网络,显著影响肿瘤微环境中的免疫排斥与T细胞浸润模式。此外,CAF亚型的比例构成被证实与患者的临床预后密切相关,为开发针对基质细胞的精准癌症治疗策略提供了重要依据。该成果展示了空间异质性在理解肿瘤进展及辅助免疫治疗中的核心作用。
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云生信日之芒
6月前
“网络毒理学+NHANES分析+转录组”进阶思路,搭配这本生信神刊,发文绝绝子! #生信分析#科研#医生#研究生#生信
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组学大讲堂
8月前
基于WGCNA分析玉米株高相关基因网络文献讲解 #WGCNA #转录组 #生命科学 #医学 #SCI
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组学大讲堂
8月前
WGCNA分析之Metascape进行基因注释富集分析 #WGCNA #转录组 #生命科学 #医学 #SCI
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致恒星辰生物
4天前
谁能拒绝转录组测序质量结果图详解(下)#生信分析 #研究生日常 #转录组 #生信分析代做
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百易基因
10月前
🔬单细胞测序VS传统测序!秒懂差异 #单细胞 #转录组 #医学生 #科研 #百易基因
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记忆LIU
2周前
告别“取样难”“难取样” ——外周血单细胞转录组测序,破局难获取组织样本的疾病研究!#医学科研 #医学临床
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空间转录组发展史
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稳妥少年·药智未来🌈
3周前
单细胞分析(scTenifoldKnk)细胞基因虚拟敲除 scTenifoldKnk是一个基于R语言开发的生物信息学工具包,专门用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的虚拟基因敲降(knockdown)分析。该方法通过构建基因共表达网络,并模拟特定基因功能缺失后的转录组变化,从而在不进行实际实验干预的情况下预测该基因的调控功能及其对细胞状态的影响。其核心算法整合了张量分解(tensor decomposition)与马氏距离(Mahalanobis distance)检验,能够识别在虚拟敲除后发生显著表达扰动的基因,进而推断目标基因的生物学作用及相关的信号通路。
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张嘴谈生信
2天前
普通转录组进行差异分析 从UCSC下载的TCGA数据进行处理后进行差异分析#sci #科研 #实验 #医学 #研究生
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杰哥的生信分析
3天前
这就是生信新风口,琥珀酰化+单细胞+空间转录组,新热点发文更容易。公共数据挖掘及多组学整合生信分析发高分SCI选题思路 #医生 #博士 #科研 #sci #论文发表
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言小七
1周前
快速搞定转录组数据:从处理到差异分析 #生信分析 #转录组 #差异分析 #数据处理 #研究生
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ai创造
1周前
单细胞转录组学解析:scRNA-seq基础与分子生物学 单细胞转录组学解析:scRNA-seq基础与分子生物学
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SCI和国自然课题组
3周前
单细胞空间转录组助力国自然中标#国自然#SCI论文#科研#科研干货#三甲医院医务人员
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言小七
1周前
发文章必备:手把手教你解读生存曲线 #生信分析 #研究生 #科研 #转录组 #r语言
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空间转录组的空间是什么?
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生信津—科研小渡
1周前
单细胞空转发文好思路 纯生信13分+ #空间转录组 #AI建模 #纯生信发文 #多组学联合分析 #国自然热点
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腾岳彩票站
1周前
空间转录组学:给基因表达贴上"定位标签"
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智汇基因
6月前
空间转录组:让你的scRNA-seq数据有了“GPS定位”#空间转录组 #单细胞测序 #多组学整合 #肿瘤微环境 #前沿技术
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稳妥少年·药智未来🌈
2周前
单细胞转录组中的细胞周期分析 单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)的革命性突破,让我们能够在单个细胞分辨率下探索组织的异质性和细胞状态。然而,在数据分析过程中,研究人员发现细胞周期状态是影响基因表达变异的重要因素之一。处于不同细胞周期阶段(G1期、S期、G2/M期)的细胞会表达特定的周期相关基因,这些表达差异可能被误判为生物学上有意义的细胞亚型差异。 细胞周期分析的核心目的是:识别并区分由细胞周期驱动的基因表达变异和真实的细胞类型/状态差异。这对于准确识别细胞亚群、发现新的细胞类型以及理解细胞状态转换机制至关重要。例如,在肿瘤微环境研究中,快速增殖的肿瘤细胞与静止的免疫细胞在周期相关基因表达上存在显著差异,若不进行校正,可能影响细胞分群和差异表达基因分析。#交换世界计划 #抖音热点记忆2025 #青年创作者成长计划
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智汇基因
5天前
影像组学+转录组:1+1>10的跨界玩法!#影像组学 #Radiogenomics #多组学整合 #无创诊断 #生信分析 #精准医疗 #医学SCI
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爱发疯爱科研的小熊
3月前
#不论结果正在做 30s搞懂基因组+转录组联合分析! 科研党速存!基因组+转录组测序分析流程,3步搞定! 1️⃣ 先做数据质控:用FastQC过滤低质量序列,去掉接头,保证数据干净; 2️⃣ 分头分析:基因组比对找变异(SNV/SV),转录组定量算基因表达; 3️⃣ 关键一步:把变异和表达关联,挖调控机制,再做功能注释! #生物信息学 #基因组测序 #转录组分析 #科研干货
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智汇基因
4周前
除了差异分析,你的转录组数据还能做这 5 件事#GSEA #WGCNA #免疫浸润分析 #候选药物预测 #ceRNA网络
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爱发疯爱科研的小熊
3月前
空间转录组实验文献,能帮咱们从空间维度了解基因表达,为探索组织奥秘打开新大门。可这类型文献满是复杂图表、晦涩术语,想吃透太难了!别愁,小绿鲸来助力。它能智能识别文献重点,帮你梳理研究思路,还能一键翻译,解决语言难题,让你轻松攻克空间转录组实验文献。 #空间转录组 #科研文献 #小绿鲸 #科研神器
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记忆LIU
1周前
当“长读长”遇到“单细胞”,单细胞三代全长转录组测序如何改变我们对基因结构和功能的理解以及它会在哪些生命科学的领域带来新的突破#医学科研 #临床医学
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生信猫_阿城学长
2周前
中医网药新赛道🔥药对研究拿下IF=5+ 中医学生看过来👀入血很重要,如果不行,那网药+代谢组本身就YYDS。成分确定 → 多组学发现表型与初步通路 → 网络药理学预测核心靶点与通路 → 分子生物学实验验证~ #中医 #网络药理学 #药学 #生信分析 #医学SCI
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智汇基因
3周前
只有转录组,怎么看缺氧 (Hypoxia)? #缺氧 #肿瘤微环境 #基因集 #生信分析
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小碗爱科研
4周前
【转录组小白】GO富集分析流程及输出结果 #GO富集 #转录组 #R语言 #生信小白 #学习
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云鸿测序
5月前
什么是转录组? 这些RNA分子共同调控细胞的生长、分化、代谢等生命活动。 #科普#科研 #转录组 #云鸿检验 #云鸿生命
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腾岳彩票站
1周前
空间转录组学“解码”肾癌:精准定位肿瘤的“空间陷阱”
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啾啾师姐聊生信
3月前
空间转录组的未来:空间多组学!#空间转录组 #空间多组学 #Xenium #Visium #蛋白组学
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晶能生物
3周前
单细胞转录组测序联合GWAS分析 随着 GWAS 在复杂性状研究中的广泛应用,一个核心挑战逐渐凸显:如何将性状相关的遗传信号准确映射到具体的细胞类型。单细胞转录组数据的出现为这一问题提供了可能,但现有方法在实践中往往给出过于宽泛的结论——多个高度相似的细胞类型同时显著,使得真正与性状直接相关的细胞类型难以辨识。这种现象在神经系统和免疫系统中尤为突出,因为细胞亚型之间在转录水平上高度相关。#晶能生物 #SEISMIC #单细胞测序 #科研 #GWAS
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云鸿测序
4月前
单细胞全转录组测序 文库构建 #科普 #科研 #单细胞测序 #云鸿检验 #云鸿生命
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生信分析手册
2周前
空间代谢组学:比空间转录组更“烧钱”但也更火!#空间代谢组 #空间转录组 #多组学 #代谢组学 #生信分析 #前沿技术 #SCI论文
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