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27共病分析+双数据单细胞合并分析+手动注释+热门基因集 27.Q1区8.5分生信部分, 共病分析+双数据单细胞合并分析+手动注释+热门基因集+细胞分亚型+细胞通讯+机器学习(Lasso+SVM)+诊断模型分析 课程购买链接:https://www.bilibili.com/cheese/play/ss258785268?bsource=link_copy 01思路介绍 02.GEO数据库疾病数据下载,第1个数据集 03.GEO数据整理 04.GEO数据添加样本类型 05.GEO转录组数据差异分析 06.GEO数据库疾病数据下载,第2个数据集 07.转录组数据整理 08.添加样本信息 09.对照组和实验组的差异分析 10.GeneCards研究的表型的基因 11.GSEA获取通路相关的基因 12.Harmonizome获得通路基因 13.三个数据库取并集 14.研究的基因和两疾病的差异基因取交集 15.GO和KEGG富集分析 16.第一个疾病SVM分析 17.第一个疾病lasso回归分析 18.第二个疾病SVM分析 19.第二个疾病lasso回归分析 20..两疾病的SVM和lasso分析取交集 21.第一个疾病的诊断模型分析 22.第二个疾病的诊断模型分析 23.单细胞数据的下载-第一个疾病 24.单细胞数据的整理 25.第二个单细胞数据下载 26.第二个单细胞疾病整理 27.单细胞数据合并 28.单细胞测序数据的初步筛选和质量控制 29.聚类和手动注释 30.提取研究的细胞 31.提取的细胞单细胞PCA主成分的选择 32.提取细胞后亚型分型(聚类和手动注释) 33.亚群中富集的Reactome通路 34.注释细胞大类和亚型细胞合并 35.细胞通讯分析 #生信分析
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