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Qiuming3周前
谷歌发布「AlphaFold 4」:性能碾压上一代 谷歌发布「AlphaFold 4」:性能碾压上一代,但开源时代终结 近日,由谷歌支持、DeepMind首席执行官德米斯·哈萨比斯领导的Isomorphic Labs公司,发布了其最新的AI药物设计引擎IsoDDE。被《自然》杂志誉为实质上的「AlphaFold 4」,这款新模型在性能上全面超越了前代AlphaFold 3。 IsoDDE是一个能够预测蛋白质结构、计算结合强度以及发现隐藏结合位点的统一引擎。在针对陌生蛋白质的测试中,其成功率是AlphaFold 3的两倍多。一个令人印象深刻的案例是,科学家花了15年才发现一个蛋白质上的第二个药物结合位点,而IsoDDE仅用几秒钟就将其找到。 然而,这一技术飞跃伴随着一个深刻且充满争议的转变:IsoDDE将完全闭源。Isomorphic Labs明确表示不会公开代码、发表论文或分享其方法。这标志着与AlphaFold开源传统的彻底决裂。AlphaFold的开源模式曾惠及全球超过300万研究人员,也是哈萨比斯获得诺贝尔奖的关键原因之一。 尽管Isomorphic Labs此举被视为保护其商业核心技术的正当行为——该公司已获得巨额融资并与多家制药巨头达成合作——但这一决定引发了科学界的广泛忧虑。研究人员无法了解其实现细节,只能猜测其工作原理。这引发了人们对「AI造福科学的开源黄金时代」可能走向终结的担忧。此举也激发了开源社区的竞争,如Boltz和Deep Origin等机构已声称达到了可比的性能水平。然而,药物发现领域对私有数据的依赖,使得开源追赶的道路充满了前所未有的挑战。AlphaFold所代表的开放精神,与IsoDDE所预示的强大但封闭的未来,形成了鲜明对比。 https://www.nature.com/articles/d41586-026-00365-7 https://www.isomorphiclabs.com/articles/the-isomorphic-labs-drug-design-engine-unlocks-a-new-frontier https://storage.googleapis.com/isomorphiclabs-website-public-artifacts/isodde_technical_report.pdf
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