粉丝1434获赞6838

各位小伙伴们大家好呀,我是努力在讲普通话的阿瓜,今天这期视频呢,主要是想分享如何用俄联曲绘制分组剧类分析热图。 热图呢?它是一种很常见的图,其基本原则是用颜色代表数字,让数据更呈现更直观,对比更明显。常用来表示不同样品主代表性基因的表达差异。不同样品主代表性化合物的含量差异。不同样品之间的一个相关性 热图,通过将数据举证中的一个各个词按一定应规律映射为颜色展示,利用颜色变化来可说话比较数据。 呃,当他运用于数值矩阵中,他就是代表含变量。以裂变量交叉处的数值值的大小要含为 基因,列为样品则是对应基因在对应样品的表达值。若涵和列都为样品展示的,可能是对应的两个样品之间的一个相关性。我们在前面也做了一个两个样品之间的一个相关性热图。 那么分组聚类热图,它是通过颜色变化与相似程度反映二维级钻鹤表格中的数据信息,它可以直观的将数据值的大小以定义的颜色来表示 成根据需要将数据与样品间风度相似性进行剧内,将剧内后数据表示在 hitmat 图上, 可将高风度和低风度的物种基因等分块聚集,通过的颜色梯度和相似程度来反映不同样品或者分子间的相似性和差异性。 那么今天我们进行操作,分组剧烈热图是如何会制的?首先打开我们的一个数据啊,这是我们的一个基因的一个数据啊,把它放到我们那个 ong 当中,然后查名称,放我们那个基因的名称,然后这个 s 轴是我们的一个主别, 同样的我们绘制这个分组剧烈的图,要需要下载一个插件,就是这个 hitmat miss and dial draugan, 就是这个插件下载并安装。我们双击他 这里的话,输入工作表,就是我们这个工作表,然后列标签,就是我们的这个长名称,然后含标签,就是我们第一列, 然后这里转化呢,我们需要将它进行标准的话,这里选择行,然后剧类选择行业列 好,点击确定,他就会出现一个呃,比较基本的一个分组剧类热图。 首先呢我们需要对他进行一个网上,他首先双击他可以对他的一个颜色进行修改,比如说我们这里啊,他是有限混合啊,因为我是二零一八版本吗?他可能就没有三色, 就是如果你有是一九二二零版本,他就有三色的,然后你就可以选择一个黄,然后就比较好看一点, 然后的话啊,当然我这里也可以调吗?我是调一个,他是一个渐变色的啊,可能不太美观,我选择一个温度的一个这个起诉会好看一点,然后他就会出 建一个这样的一个分组距离热图。另外呢我们还需要对他一个这个标签进行修改,因为他这是竖的吗?那么将他进行一个修改, 然后这里选择他的一个格式,他这里旋转了九十度,我们旋转四十五度,然后就更加好看一点 啊。其次我们需要对他一个啊,这个这个他的一个标签进行一个设置,我们把白色、黑色去掉,双击他,然后把这个级别引成头尾两集, 顶着应用把它去掉。另外他这个标签这里的话啊,他是有的是 三位数,有的是两位数,我们设置成两位数比较好看一点,然后这个数字这里自定义改为使劲字,然后设置小数位数,选择二点击应用,然后他这样就好看了一些,然后其他的应该就没什么了, 然后点击确定,那就是我们那个分组剧烈热图,因为我的一个对他的一个默认字体首先就默认的新罗马,所以我就不用对他这个进行修改,但是呢,他的一个大小好像还是,呃,需要我们进行一个修改比较好一点。 这个十二,嗯,让他变大一点,要十四好看一点,这个也变大。 好的,今天的一个呃视频就到这里了,如果对你有用的话,请记得一键商量啊,拜拜。

分享 orange 绘制下三角热力图?如何利用 orange 绘制这样的热力图呢?首先选中数据绘图等高线图带标签热图, 然后双击图片,打开绘图细节,在颜色映射下的填充颜色中选择下三角,在标签下的标签显示中也选择下三角。最后就是设置做标轴字体等格式了,认真看,好好学吧,就不一一说明了。

分享 ov 剧绘制带有标签的热点图,小伙伴们想要的热力图,今天他来了!首先选中数据,找到统计描述,统计相关系数,然后选择计算出来的相关系数,在绘图下找到等高线图带标签热图。最后就是设置格式了, 小伙伴们仔细观看,认真学哦!

像屏幕上方这样一种带数据标签的热点图是如何制作的呢?首先我们在 orange 中打开工作标,将我们的数据粘贴到工作标中,数据的排列方式如屏幕上方所示。 首先在我们的每一页上面,我们放的是我们的一个分类数据,在这一幅图中,我们想表达的是 使用效率的一个分级呈现,所以我们一共包含了低效率、较低效率、中等效率、较高效率以及高效率五个分级标签。那在我们的一个行上面 是我们地区的一个分类数据,这里一共有七个地区,那我们的每一个数据代表的是什么样的含义呢?举个例子,在第一行第一列上面代表的是 a 式的一个低效率值的一个分布, 那第一行第二列上面代表的就是 a 式的一个较低效率值的一个分布。将数据整理好之后,我们需要同时选中 所有的数据,然后点击顶部的绘图菜单,在等高线图中选择第一行上面的带标签热图,点击进入一个图形绘制的设置界面当中。首先我们需要设置 y 值,我们将 y 值 在下拉小三角中设置为列标签,这次我们需要设置 x 值,我们将它的一个下拉小标签选择为选中区域的第一列,然后点击确定, 可以看到我非常粗糙的热点图就做好了,接下来进行格式的美化,首先我们可以将它的一个横坐标和纵坐标的一个名称给它删除掉。接下来我们 需要对热点图的一个背景颜色进行更改,同样的是双击热点图的任意区域,打开菜单栏中的颜色映射,然后再填充颜色中点击左边的小画笔,再加载调色板中点击 色彩条,在出现的下拉色彩条选择框中选选择我们喜欢的一个颜色,点击确定,点击应用,可以看到背景的颜色就已经改为我们喜欢的颜色了。 接下来我们需要为图中的一个数据标签进行一个格式的更改。同样的再次双击我们的热点图任意区域,打开标签,设置格式菜单,在字体的下拉小三角中将他的一个字体改为新罗马,将他的字字号 我们改为十四号。点击应用可以看到数据的一个大小和字体就已经更改过来了,但是可以发现数据的颜色有的是白色,有的是黑色,那如果说我们想要使它成为同一种颜色,比如说是白色,我们就需要在这个 字体的设置中将它的自动改为白色。点击应用,点击确定,可以发现所有的数据标签就变成白色了。接下来我们需要对横纵坐标的一个 标题进行更改,首先我们来更改横坐标的一个格式,那我们双击横坐标的任意一个数数字, 在坐标轴设置菜单中,我们选择下轴。首先我们对刻度线标签进行一个更改,在刻度线标签中,我们将它的一个显示位置点击为 格式,在其中为它的字体进行一个更改,选择送体,把它的大小改为十六号。同时我们想要使它的一个标签进行一叠方向的一个旋转,我们就需要在旋转 这小三角中给他选择一个合适的角度,比如说四十五度,然后点击应用,可以发现我们的一个横坐标标签就更改过来了, 下来我们来更改纵坐标的标签,在坐标轴设置菜单中,我们点击左轴,同样的是在刻度线标签下面的格式中,为他的字体 进行一个更改,字号进行一个更改,点击确定,那可以发现横坐标和纵坐标的一个标签格式就更改过来了。接下来我们为我们的一个图例名称进行一个更改, 双击图例名称,然后直接进行一个修改,单击图例,在上方的一个字体和字号中进行更改。所有的步骤基本上都做完了,这样一幅带标签的热点图就做好了。

哈喽,小伙伴们大家好,今天我来分享一下如何用二维真绘制相关技术的旅途。我们首先看到今天这个案例用到的一组数据,也就是时航四列, 也就是十个样本,然后每个样本从有四个变量,然后呢我们先在这里边对这个这组数据求一个相关系数举证,我们全部选中,点击统计,然后呢点击这个描述统计, 然后把这个相关技术可以计算出来,通常有三种类型,我们通常选第一种皮尔逊相关技术就可以了,然后点击确定,完事之后呢,在原来的顾客当中就生成了一个相关技术表格,我们可以看到这个结果呢,它是一个四成四列的方阵, 关于主对角线是对称的,我们把它全部选中,点击这个绘图,选这个带标签的这里图绘制,然后呢我们这里把 标题都给去除掉外,标题可以去除,然后呢这标题他是 parents and co relation coefficientpcc 这个系数,然后我们点击确定,然后就能生成我们这个热力图,这个热力图是不是和我们看文献中的有所不一样呢?我们把它修饰一下就可以了。首先我们把这个标题给去除掉, 然后呢点击右边这个 sy 坐标轴,给他翻转一下,变得更符合我们的直觉。然后我们通常所见到的是不是这个对角线呢?他是在主对角线,所以我们需要对这个坐标轴进行一个调整,我们双击这个坐标轴,然后呢再垂直这一栏,点击这个翻转, 翻转完事之后呢,这个对角线就变成主对角线了,然后我们可以看到上面这个刻度线标签呢,他应该是在下边的,他现在在上边,所以我们把上面给隐藏了点这个刻度线标签,然后把这个下 下轴给隐藏,然后把这个上轴给显示,点击应用,然后这样就可以了。最后我们把这个所有的框线给都给去除,点击轴线和刻头线,然后把所有的这个轴都给选中,然后把这个刻头线给隐藏掉, 最后呢点击这个确定,这样就变成我们想要的形式了。最后呢我们还可以变成这个上三角或下三角的形式,然后我们点击这个热力图双击,然后再填充这一段,可以改变这个颜色,这个颜色版是根据自己的爱好去调节的,我们选一种其他颜色吧。 嗯,然后点击确定应用,然后这个颜色版就更换了,然后呢我们点击这个填充显示,改成下三角,然后标签呢也改成一个下三角,要对应起来这个数字形式呢,我们显示两位小数就可以了, 然后点击这个应用,这个数字如果太大,我们还可以在这个字体里边更改,改成一个嗯,你觉得合适的字体,比如说三十号字吧。然后就点击应用,点击确定,然后这样的话就是 ov 证绘制相关技术率图的一个方法,大家学会了吗?

各位小伙伴们大家好呀,我是努力在讲普通话的阿瓜,今天这期视频呢,主要是想分享如何用我允许绘制相关性热图。今天我们也不讲什么是相关性热图,我们就直接进入我们的一个正题,我绘制他的一个相关性热图。 首先打开我们的宝林举软件,呃,在这里插个体外画就是,一般你要做这个图的话,一般是需要宝林举 pro 版本,呃,二零二零或者二零二一,二零二二版本以上才行 啊,因为我之前是二零一八版本的,我今天晚上也在努力的去调他,结果还是不行。后面我就一直在下载这个软件,但是你找这个软件也比较 麻烦,后面的话我会把它放在评论区里面,大家可以直接下载使用,然后参考另外一个 app 组的一个安装教程就可以了。好的,回到我们的一个言归正传 啊。首先的话,我们点这这个 app 里面,如果你有这个插件就是呃 correlations plot, 你就可以不用添加 app, 如果你没有的话,你就点击 app 里面,然后定情添加这个插件就可以了。 然后接下来我们点击这个相关性热图,因为 a 图是我们的一个 a 列, a 列代表是我们的主,别吗?然后这一列代表是我们的一个影响因素,就是他们之间的一个相关性,比如说这个水分含量,这个 ph 啊什么之类的, 他们之间的相关性是怎么样的?那我们就选择 bcd, 就是选择这里几列就可以了, a 列就不用选择。后面的话,我们点击这个 autoploy view, 他就会出现一个预览图。 首先的话啊,我们看这个他的一个相关性,他有,我们把它放大,他有有三种,一个是皮亚逊,一个是斯尔曼,一个是肯德勒,一般都是这三种,但是我们用的比较多的就是皮尔逊相关性分析,我之前用 spass 啊,这是其他的也进行做出来给大家啊。看了另外一个视频里面,但是我们用图片可能更好的一个说明的一个问题。接下来我们就看 cycle, 就是我们这个现在的一个圆形,首先的话他圆形越大代表他的一个相关性越好,而且红色代表是他正相关,蓝色代表是负相关 啊,如果你不知道他大就是圆形越大代表相关性越好的话,你就看中间这一条斜杠线 啊,比如说大陆梯跟大陆梯他的相关性肯定是一嘛,所以他的啊状态是最大的原型,所以你就可以看得到相关性越大的时候他的原型是越大的。 好的,接下来我们换另外一个表示方法,就是椭圆,椭圆的话啊,可能在我们印象当中可能他越大就相关线越大越好,其实不是的,你看斜杠线,他的是呃, 成一条直线的时候,他的相关性是最大的,就是一,所以说明了椭圆的时候他的一个越扁,他的一个相关性是越好的, 所以的话他一个红色也是代表正相关,然后蓝色还是代表副相关,也是这样看的。然后第三个是咖了,然后他这里显示不出来,就不管他了,也,我们我们也一般也不用。第四个是 number, 是直接出现他的一个相关系数的, 就是这样的直接出现相关系数,然后我们也就不用管他 呃,用的最多的是他的一个混合体系。比如说我这个呃一般都是用相关系数,以他的一个图形进行结合, 比如说上面是圆形,下面是我这个相关性啊,这样用的比较多的一点。另外的话,其实你还可以换他的一个上下这两边的一个位置, 比如说点击这个 apple, 然后他就变成这个下面了,但是我们用的比较多,是啊,上面的这一种, 还有就是比如说我这个腮口啊,我们一般看的图,看的时候,我们一般其实我们用的不是整个平图用的,比如说我用的就是这一半的图,这就是我们一个相关性, 当然你也可以放到上面吗?一样的,就他就变成这样,我们看的比较多,是这这两种,是吧? 在文献当中。然后另外的话,我们看我们的一个,比如说我们现在选择圆形吗?其他的也一样哈,我们就举这个圆形为例子,他这个是啊,就直接显示在我们图片当中了吗? 这是我们的一个相关系数啊。第二个是他的一个坯子,他坯子小于零点零五, 而这大一零点零五,它才会显示出来,这是我们那个呃相关的一个显著线。比如说, 比如说就是他这个是不相关的嘛,然后他就会点个叉,这个是呃相关的,他就会点一个这个 呃新号。这是啊,刚刚我讲错了哈,这个是显著的一个标注,这个是不相关的一个标志,刚刚那个这个叉号就是不相关的标志 啊,这个是显著的标志,当然你可以啊,如果你只有一个点的话,我们也可以设置成两个点,就是,呃,更加显著的,比如说零点零一, 就是我们点一个空格,零点零一看他就会出现两个,再点一个,当然也可以设置成三个零点零零一,他就会出现一个这样的一个图 啊,大概的一个相关性热图就是这样绘制的。我们啊,接下来我们就弄弄成一半的那种,比如说弄成这种我们建的比较多的就是这种吗? 然后这里的话是你的一个,这是披植的这代表的一个图形,然后我们绘制好之后我们点 ok, 他就直接到我们这个页面,然后这个的话你再移动一下,然后把它放在底下会更好看一点。其他导出啊我就不教了,之前呢我们也讲过了。好了,今天的视频就这么多了, 谢谢大家的一个观看啊,如果对你有用的话,请记得关注加三连哦,谢谢。

大家好,今天来教大家怎么用 orange 来做相关稀释图,也就是 correlation plot。 那么首先打开这个 orange 的软件,我用的是二零二一版本,是在淘宝买的,然后在这里左上角创建一个新的项目, 然后创建之后就会出现这个表格,让你输入相关的数据, 我这里已经有现成的数据了,也就是这样,比如我想要探讨不同样本之间 的基因表达的相关性系数,那我可以把第一列把基因填进去,然后每一列后面的每一列从第二列开始是一个独立的样本, 这些数字就是每个基因在相应的样本的表达值。 那么输入这个数据之后,我就点这个右边这个 correlation pro, 也就相关系数图。 那么有的同学会发现,一开始这个相关系数图的功能不是默认就有的,需要去添加,但是 也有的版本或者软件会出现点这个添加,添加不了,那么我也咨询了在淘宝买的那个店主,他就发了这个 origin 的 a p p 给我,上面有各种 a p p 就可以 把它拉过去,你要安装哪个就把它拉过去,就可以添加了, 它就添加到这里了。那么我这个版本已经安装了这个 correlation plot, 也就是 输入了你想要分析的数据之后,按一下这个相关系数分析,然后左 边这里选择全部,注意选择全部之后把这个俊基因去掉,也就是把第一列的要去掉,去掉之后呢,其他的都是选中的状态了。 然后右边的上方可以选择三种计算方式,包括 person 以及另外两种相关系数的计算方法,那么我这里选择 person, 然后这些是默认的一些参数,我首先点击这个打勾, 预览一下它的效果是怎么样的,你看从这个预览图可以看出, 他就是分析了不同样本之间的基因表达的一个相关相关性, 我们可以试一下其他参数是有什么不一样,这个是里面的这个形状的,呃,具体的一个形状,比如 cycle 就是圆圆圈, 这个是这样的椭圆形,然后选择 color, 就是根据颜色来区分, 这个是一个相关系数,这个是图形与 这个相关系数的结合。你看这里就可以看出,其实有的同学就会发现他右上的这个三角形跟左下的这三角形是一样的,只不过他 就是以不同的形式来表现,他这个相关系数对应的就是上面的这些图形的大小。我们也可以换一下位置,比如现在就是上面是系数,下面是圆, 这里也可以改变上方的一个形状,比如把上方的圆 改成椭圆或者颜色 label 就是它的标签,就是那个每个方框里面要显示什么,这个是相关系数, 这个是显示 p 值, 这个是显示 这个不显著的标记,这个是显示显著的标记, 显数的标记,这里默认的是零点零五,也就小于零点零五的他就打一颗星。那么我们想要有不同的 p 值层是怎么样呢?比如小于零点零一, 还有小于零点零零一,那么我就在零点零五这里首先打一个空格,输入零点零一, 他就会多了一些框,他就出现了两颗星,两颗星就表示是小于零点零一,如果还想加多小于零点零零一的,就再敲一个空格,输入零点零零一, 这样他就会出现有些方框,他是三颗星的就表示小于 p 值小于零点零零一,两颗星表于表示 p 值小于零点零一, 一颗星的表示 p 值小于零点零五,那么其他的大家 就可以自己去尝试,喜欢怎么样的就调成怎么样的。比如我个人是比较喜欢这里选择 color, 就是用颜色来表示, fun 就是我刚说的,其实下面的一半跟上面一半是一样的,那么我不需要重复,我就可以选择这样一半或者在上方,当然我个人是比较喜欢这个三角在下方的, 那么这样我就是我个人比较喜欢的效果了,只显示一半,然后啊不同的星星数量表示不同的一个 p 值的范围,那么我就点击 ok, 点击 ok 之后呢这些可以调整字体的格式,默认的是 over, 一般都不用修改,你可以修改一下它的字体的大小, 你看这个字体跟图形之间有一定的间隙,你可以淡季一下,之后他就全部选中了,你可以往上移, 这边也是一样的,可以往右边挪一点,还有这个也是可以往这边挪动的, 那么这样子就可以做出一个相关。 我刚刚双击了这个轴,那么他弹出一个框,这些可以设置更多的细节, 这些我就不一一说了,因为最常用的操作就是我刚刚所说的了。 然后我们可以把图片输出 这里设置保存的路径,比如我保存在桌面 这里,你可以命名 这里选择图形的格式。我个人一般比较喜欢 pdf, 因为它是一个时量图,你选择 pdf 之后,它输出的就是一个时量图,然后点击, ok, 我们来到桌面看一下,那么这个就是我们刚刚生成的图片, 你看适量图的好处就是不管放多大,他都是非常清晰的。 好了,那么今天就讲解到这里。