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4月前
如何看膜蛋白是否有信号肽(后附实操)一、基础概念 并非所有的膜蛋白都有信号肽。膜蛋白的定位和插入膜中的机制多样,信号肽只是其中一种途径。以下是关键点的总结: 1.信号肽的作用 信号肽通常是一段短肽序列(15-30个氨基酸),指导蛋白质到内质网(ER)进行翻译后加工,最终定位到质膜或其他膜结构。这类蛋白依赖分泌途径(如Sec61复合物)或信号识别颗粒(SRP)系统。 2.无信号肽的膜蛋白 多次跨膜蛋白(如G蛋白偶联受体):可能通过内部信号锚定序列(SA序列)直接插入膜中,无需N端信号肽。 线粒体/叶绿体膜蛋白:通常依赖N端前导序列(与经典信号肽不同),通过TOM/TIM复合物插入膜。 细菌膜蛋白:某些通过SRP非依赖途径(如YidC系统)插入膜。 尾锚定蛋白(Tail-anchored proteins):C端疏水序列指导定位(如Bcl-2家族蛋白),通过GET/TRC通路插入ER膜。 3.例外与多样性 某些单次跨膜蛋白可能通过跨膜域本身直接嵌入膜,无需额外信号。 病毒膜蛋白(如HIV的Env)可能利用宿主细胞的非经典分泌途径。 结论:信号肽是许多膜蛋白的常见特征,但并非必需。不同膜蛋白根据功能、定位和进化适应,会采用多样化的膜靶向机制。 二、实操 1.方法1 直接NCBI搜索,点击蛋白质或氨基酸序列,如果该蛋白有信号肽,则会有特定的一列“signal peptide” 2.网站:https://services.healthtech.dtu.dk/services/SignalP-4.1/ 如图,没有信号肽的话tag就可以任意放N端或C端了,有信号肽的话就得考虑把tag换到C端或直接把信号序列去掉。如图。#科研学习 #研究生 #膜蛋白 #科研狗的日常 #医学生
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