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📌多组学(转录-蛋白-代谢)联合分析。📍核心逻辑:单组学质控筛选→通路交叉锁定→分子匹配验证→实验确认,层层缩小范围,排除假阳性。 🖇️一、前提:单组学基础质控 先完成各组学差异分子筛选,确保数据可靠: 转录组:测序 Q30≥85%,|log₂FC|≥1、校正 P<0.05,过滤无注释基因; 蛋白组:肽段 FDR≤1%,FC≥1.2/≤0.83、校正 P<0.05,保留有功能注释蛋白; 代谢组:峰面积归一化,VIP≥1、FC≥1.2/≤0.83、P<0.05,匹配 KEGG 化合物 ID。 🖇️二、通路富集与交叉验证 各组学分别做 KEGG 富集(校正 P<0.05),统一物种注释(如人类 hsa); 粗筛:选三组 / 任意两组共富集的通路; 精筛:优先选富集校正 P<0.01、富集因子≥0.2 且与研究表型相关的通路; 趋势验证:通路调控趋势在各组学一致(如上调通路需基因 / 蛋白、代谢物产物均上调)。 🖇️三、关键分子筛选 核心通路内聚焦限速酶 / 核心蛋白及其催化的底物 / 产物,筛选同时满足:① 三组学均为差异分子;② 跨组学相关性显著且符合通路逻辑(如酶蛋白上调对应底物减少);③ 有直接生物学调控关系的分子。 🖇️四、实验验证 细胞 / 动物水平干预关键基因,验证对应蛋白、代谢物变化与分析结果一致; 临床样本验证分子关联及与表型(如肿瘤分期)的关系。 ▪️避坑要点 统一物种注释、校正批次效应;仅在核心通路内匹配分子,优先酶 - 底物等直接调控对,排除跨通路无意义关联。 #医学 #sci #生信分析 #医学实验 #科研
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