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sh-RNA与si-RNA介绍 Si-RNA 指一类长约21-23nt的双链RNA分子,一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因。si-RNA一般是人工合成的线性双链RNA(ds-RNA),并且,si-RNA的双链区是完全互补配对的。 Sh-RNA 是一种依赖茎环序列产生的短双链RNA结构(19-25nt),可利用载体导入细胞当中,在细胞中经酶切形成si-RNA,通过RNA干扰途径调控目标基因。shRNA则是通过发卡结构形成的局部双链RNA。Sh-RNA的双链区则是不完全互补配对。 si-RNA和sh-RNA均属于RNA干扰的范畴,指由一段短双链RNA引起的基因沉默现象;Si-RNA和sh-RNA有着极其相似的地方,但是它们的区别有又是存在的,主要体现在这几个方面:转染途径、干扰途径、作用时间、表达水平、脱靶率(后面大助理会出几期视频,详细讲解这一部分内容)。 虽si-RNA可以在体外合成,但也常用较长的双链RNA作前体,ds-RNA通过转染进入细胞,在细胞质内经过一系列酶处理,形成成熟si-RNA,然后与RISC(RNA-induced silencing complexes)结合,最后与靶标mRNA配对,导致靶标mRNA的降解。而sh-RNA则需要依托于载体、病毒、农杆菌等媒介,通过转化/侵染进入细胞,在细胞核中转录形成茎环双链,经过Drosha等酶的加工,形成成熟sh-RNA,然后转运至在胞质,在核糖核酸酶的作用下形成si-RNA,进入RNAi路径。 #科研 #siRNA #shRNA #RNA #实验室
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